Embrapa Agricultura Digital
Busca de Projetos
Aplicação de técnicas de reconhecimento de padrões usando os descritores estruturais de proteínas da base de dados do software Sting
Foto: Furukawa, Neide Makiko
As enzimas têm sua função determinada essencialmente por alguns resíduos específicos, denominados de resíduos catalíticos. A maioria dos métodos para a predição dos resíduos catalíticos de enzimas utiliza ao menos um critério de conservação da sequência primária. Considerando que a função é decorrente da estrutura, este projeto almeja identificar dentre os descritores estruturais disponíveis na base de dados do sofware Sting aqueles de maior relevância para discriminar os resíduos catalíticos. Assim, o projeto vai propor um novo método classificador para enzimas usando estes descritores como dados de entrada. Entre os resultados esperados estão: novos métodos para a seleção dos descritores estruturais mais importantes para o reconhecimento dos resíduos catalíticos; determinação de assinaturas de descritores específicas para grupos de enzimas, constituídas por consultas formadas pelos delimitadores inferior e superior de intervalos de valores para cada descritor selecionado; criação de "tabela periódica" das assinaturas por famílias e subfamílias proteicas; análise estatística multivariada de dados da base de dados Sting com intuito de validar o método e identificar os resíduos catalíticos das novas proteínas.
Ecossistema: Amazônico, Äreas Costeiras, Campinaranas, Extremo Sul, Floresta Atlântica, Florestas Semideciduais e Estacionais, Meio Norte, Pantanal, Região Caatinga e Florestas deciduais, Região dos Cerrados, Região dos Pinheirais, Transição Ecológica
Situação: concluído Data de Início: Sun Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2010 Data de Finalização: Thu Jul 31 00:00:00 GMT-03:00 2014
Unidade Lider: Embrapa Agricultura Digital
Líder de projeto: Goran Nesic
Contato: goran.neshich@embrapa.br
Palavras-chave: STING, enzimas, famílias e subfamílias protéicas, biologia computacional, bioinformatica