Software de código aberto, voltado à comunidade de bioinformática que possibilita aos usuários o armazenamento, a busca e a visualização de dados biológicos, constituindo-se num importante ferramental em programas de melhoramento genético. Para sua constituição e funcionamento, o software Machado Genomics utiliza de duas ferramentas principais: o framework Django (possibilita que usuários desenvolvam novas funcionalidades com agilidade) que interage com bancos de dados Chado, de licença GPL e que condiciona o Machado a também se constituir num software livre. A linguagem de programação é o Python.

O Machado Genomics contém ferramentas para carregar os principais formatos de arquivos de dados biológicos (fasta, gff, obo, bibtex, interproscan, orthomcl) e uma API para fornecer dados diretamente para o navegador de genomas Jbrowse. Dessa forma, o ativo permite aos grupos de pesquisa, armazenar dados genômicos, além de oferecer buscas responsivas com navegação, consulta e visualização.