A Embrapa investe na conservação de estirpes nativas de microrganismos, que podem ser utilizadas pela comunidade científica em diversos programas de pesquisa, envolvendo desde o diagnóstico, o tratamento de doenças e a produção de vacinas para aplicação humana e animal até a redução do impacto ambiental de processos produtivos e a geração de energia renovável. Nessa perspectiva, as culturas microbianas estão sendo continuamente estudadas para a formação de uma base de dados de «ativos» componentes e suas respectivas atividades biológicas, de modo a transformar esse acervo microbiano em recursos mais explorados.

Por exemplo, o uso de fixadores de nitrogênio, inseticidas, fungicidas e herbicidas biológicos, biorremediadores e promotores de crescimento de plantas produzidos por microrganismos são ferramentas que podem atender às demandas por maiores rendimentos das culturas agrícolas, ao mesmo tempo, reduzindo a liberação de produtos químicos no ambiente.

A conservação adequada desses microrganismos é o que irá garantir esse material genético para estudos de aplicação no agronegócio e setores produtivos relacionados.

As coleções de microrganismos mantêm espécies com potencial para o controle biológico de pragas, doenças e insetos vetores de doenças; multifuncionais; fitopatogênicos capazes de causar doenças em diferentes culturas de importância econômica e que, por isso, podem ser usados em programas de melhoramento genético de plantas para seleção de variedades resistentes; e de interesse para a agroindústria e produção animal.

A vertente microbiana do Portfólio de Recursos Genéticos da Embrapa visa garantir a gestão adequada de seu acervo microbiano, atendendo às demandas de matéria prima e insumos para a agropecuária e preservação ambiental. Para isso, abrange as seguintes ações:

- Coletar, identificar e conservar a longo prazo de microrganismos agentes de controle biológico no Centro de Recursos Biológicos (CRB-ACB) da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia

- Implementar e monitorar sistemas da qualidade nas três categorias de coleções de microrganismos da Embrapa (Centros de Recursos Biológicos, Coleções Institucionais e Coleções de Trabalho), com base no modelo corporativo de gestão desenvolvido no âmbito do projeto GESTCOL

- Coletar, identificar e conservar bactérias diazotróficas e outros microrganismos multifuncionais no Centro de Recursos Biológicos Johanna Dobereiner (CRB-JD) da Embrapa Agrobiologia

- Coletar, identificar e conservar bactérias diazotróficas e promotoras de crescimento vegetal no Centro de Recursos biológicos em Microrganismos Multifuncionais da Embrapa Soja (CRB-MM)

- Coletar, identificar e conservar microrganismos multifuncionais de importância agrícola e ambiental no Centro de Recursos Biológicos em Microrganismos Multifuncionais de Importância Agrícola e Ambiental (CRB-MMIA) da Embrapa Meio Ambiente

- Coletar, identificar e conservar microrganismos em Coleções Institucionais da Embrapa

- Realizar ações de intercâmbio e quarentena de microrganismos

- Organizar e informatizar os recursos genéticos microbianos no sistema AleloMicro

- Consolidar o sistema de curadoria de microrganismos e promover sua interação com curadores e unidades detentoras de coleções microbianas.