Nas regiões tropicais, a infestação de bovinos por carrapatos causa redução drástica na produtividade de leite e de carne, podendo levar em alguns casos à morte dos mesmos. Produtos químicos têm sido normalmente utilizados para combater o carrapato, no entanto, esta estratégia leva à contaminação dos produtos leite e carne além do meio ambiente. A variabilidade genética existente entre as raças de Bos taurus e Bos indicus para características associadas à resistência ao carrapato e as ferramentas disponíveis atualmente da genética molecular possibilitam a sua utilização desta informação nos programas de melhoramento com o objetivo de se obter animais mais produtivos e adaptados, por meio de seleção assistida por marcadores ou transgenia. Foi utilizada uma população de animais mestiços (Holandês x Gir), com o objetivo de identificar genes relacionados à resistência ao carrapato. Foram construídas duas bibliotecas de cDNA de pele de animais infectados resistentes e susceptíveis ao carrapato bovino. Foram sequenciados mais de 4.000 clones das bibliotecas e foram estudados os padrões de expressão gênica diferencial entre as sequências das bibliotecas originárias de animais resistentes e susceptíveis ao carrapato bovino. Utilizando a técnica de PCR em tempo real, foi estudada a expressão de genes candidatos biológicos, ligados à produção de citocinas. Por meio da técnica de micro arranjos, foram analisados os perfis de expressão gênica diferencial entre amostras de cDNA de animais resistentes e susceptíveis ao carrapato, para mais de 23.000 genes. Ao final, este projeto possibilitou o melhor entendimento das rotas metabólicas envolvidas nos mecanismos de resistência ao carrapato bovino, por meio da identificação de dezenas de genes candidatos. Novos experimentos devem ser realizados para validar a ação destes genes.