Identificação de patógenos virais em videiras provenientes de bancos ativos de germoplasma e coleções utilizando sequenciamento de última geração, diagnóstico viral e limpeza clonal
Identificação de patógenos virais em videiras provenientes de bancos ativos de germoplasma e coleções utilizando sequenciamento de última geração, diagnóstico viral e limpeza clonal
A videira frequentemente é infectada por vírus devido às suas características de cultivo e propagação. Resulta desse fato algumas dificuldades para o diagnóstico viral nessa cultura. São conhecidas cerca de 60 espécies virais capazes de infectar a videira, as quais constituem importante ameaça à viticultura brasileira e mundial. Assim como verificado em relação aos vinhedos comerciais, uma das principais ameaças à manutenção de acessos de videiras em bancos ativos de germoplasmas (BAGs) e coleções de cultivares, mantidos por instituições brasileiras de pesquisa em campo, é o ataque de pragas e doenças, com destaque para as viroses. Nessa linha, com esse projeto será utilizada uma técnica inovadora de diagnose de patógenos de plantas, baseada na tecnologia do sequenciamento de nova geração (Next generation sequencing, NGS) para detectar e identificar patógenos virais presentes em acessos de videiras. Essa técnica permitirá a rápida, abrangente e sensível identificação do “viroma” (população de patógenos virais) presente em genótipos selvagens e em espécies cultivadas de videiras, ambos importantes no processo de desenvolvimento de novas cultivares de uva para a vitivinicultura brasileira. Os resultados do sequenciamento NGS permitirão a identificação dos patógenos e a proposição de estratégias de manejo e controle de doenças virais conhecidas ou novas, contribuindo para a sustentabilidade da cultura da videira, frequentemente ameaçada pela incidência de doenças. O projeto inclui também uma etapa de validação dos resultados obtidos por NGS, com a definição de reagentes para a detecção por RT-PCR dos vírus identificados. Essa validação (indexação) será conduzida em vários acessos de videiras, provenientes de BAGs e de coleções mantidas por instituições de pesquisa. Alguns acessos de videiras, dentre os mais ameaçados por viroses, serão estabelecidos in vitro para a realização de termoterapia e cultura de meristemas com o objetivo de recuperá-los e reintroduzi-los sadios nos BAGs e coleções originais. Em síntese, as ações desenvolvidas no projeto pemitirão: aprofundar o conhecimento sobre os patógenos virais da videira e sua variabilidade; gerar tecnologia visando incrementar o diagnóstico viral; e promover a melhoria na conservação e na segurança de acessos de germoplasmas de videira.
Situação: concluído Data de Início: Fri Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2014 Data de Finalização: Mon Jul 31 00:00:00 GMT-03:00 2017
Unidade Lider: Embrapa Uva e Vinho
Líder de projeto: Thor Vinicius Martins Fajardo
Contato: thor.fajardo@embrapa.br
Palavras-chave: recursos genéticos, NGS, vírus, limpeza clonal, diagnóstico