A seleção para fenótipos desejáveis tem sido praticada em bovinos desde sua domesticação, ocorrida há aproximadamente 10.000 anos. Tal processo de domesticação provocou mudanças acentuadas em características comportamentais e morfológicas nas subespécies e, juntamente com o desenvolvimento das raças e dos programas de melhoramento genético, propiciou o aparecimento da enorme variedade de padrões e de tipos raciais conhecidos atualmente. Desde então, as ferramentas de melhoramento tradicionais, baseadas na teoria quantitativa, têm assegurado ganho genético continuo na maioria das características de interesse econômico, mas a seleção tem sido realizada sem o conhecimento do efeito dos genes que atuam nas características de interesse. Em decorrência, pesquisas mais recentes têm sido direcionadas para incorporar ao processo de seleção as informações de marcadores moleculares que estejam associados à substancial variação genética de algumas características relevantes. O valor dessas pesquisas está relacionado ao potencial uso da seleção assistida por marcadores (SAM), que visa à redução do intervalo de gerações e à diminuição do custo dos testes de progênie por meio da maior confiabilidade na seleção dos animais. Assim, a inclusão de marcadores ao processo de seleção pode duplicar os ganhos genéticos e diminuir os custos de testes de progênie tradicionais em até 92%. Nas duas ultimas décadas, foram identificados vários tipos de marcadores moleculares para uso na SAM, entretanto, verificou-se que únicos polimorfismos com densidade suficiente para o aumento das confiabilidades são os SNPs, os quais têm sido utilizados nos chamados chips de DNA. De forma complementar, o sequenciamento de genomas por tecnologias de nova geração - next-generation sequencing - apresenta-se como estratégia para o eficiente delineamento de estudos de associação global que possibilitariam, entre outros, a identificação de regiões genômicas sujeitas à seleção natural/artificial nos animais de produção.A identificação dessas regiões pode levar as inferências iniciais sobre os genes ali presentes, os quais podem estar envolvidos na manifestação de características de importância econômica em bovinos leiteiros. Ainda, as analises de assinaturas de seleção podem levar à identificação de mutações causais que possam conferir vantagem adaptativa ou produtiva às populações, raças ou espécies. Atualmente, a identificação dessas regiões é um dos principais interesses dos geneticistas, pois pode auxiliar desde o entendimento de processos básicos envolvidos na evolução dos genomas até a descoberta da função de genes/regiões genômicas. Deste modo, este projeto visa estruturar uma rede institucional para, por meio de um delineamento eficiente para estudos de genômica populacional, combinado com o uso de sequenciamento de nova geração, gerar dados suficientes que permitam identificar polimorfismos no genoma bovino com elevada saturação. Os polimorfismos constituirão os dados de entrada para a realização de analises de assinaturas de seleção para que se possa identificar as regiões/genes de importância na pecuária bovina. Esta nova rede deverá se integrar à Rede Genômica Animal II. A organização permitira´ a produção de resultados diversos, incluindo o desenvolvimento e/ou aprimoramento de metodologias para a integração da informação dos SNPs aos testes de progênie. Tal integração possibilitará a pré-seleção de touros jovens, com impacto no aumento dos ganhos genéticos, na redução dos custos e na seleção mais confiável de vacas.