Estudos mostraram que bactérias endofíticas têm maior potencial de suprimento de nitrogênio derivado da fixação biológica de nitrogênio (FBN) para o sistema planta-solo. Por outro lado, trabalhos que utilizaram uma técnica independente de cultivo de cana-de-açúcar revelaram forte atividade de bactérias fixadoras de nitrogênio previamente não caracterizadas para essa cultura, o que demonstra que estratégias independentes de cultivo são essenciais para a compreensão da diversidade genética da estrutura populacional, do papel ecológico e das características funcionais das bactérias endofíticas.
Tendo isso em vista, este projeto utilizou a metagenômica para estudar as bactérias endofíticas promotoras do crescimento vegetal em cana-de-açúcar. A metagenômica permite uma visão global dos fenômenos simultaneamente em todos os genes, possibilitando, inclusive, a identificação de atividades como a própria FBN e a disponibilização de outros nutrientes, como fósforo e zinco, a síntese de fito-hormônios ou a proteção contra patógenos.