Desenvolvimento de um sistema de bioinformática aplicado à descoberta de genes relacionados a estresses abióticos em plantas

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As mudanças climáticas podem afetar a produtividade agrícola e devem impactar a produção de alimentos em um futuro próximo. A criação de cultivares tolerantes a estresses abióticos, como a seca por exemplo, pode ser uma das maneiras de se adaptar as culturas agrícolas a esses efeitos. O processo de criação de cultivares passa pela descoberta de genes, um processo computacional de seleção de genes por meio de análises de bioinformática usando genomas, vias biológicas, dados de expressão gênica, dados da literatura, entre outros. Neste projeto, propõe-se a caracterização de genes, ou proteínas com função desconhecida (PFD), pela construção de redes de coexpressão gênica. As redes serão construídas usando dados de genomas e transcriptomas públicos de plantas que possuam experimentos relacionados a estresses abióticos. Os resultados das análises e os dados obtidos serão armazenados em um banco de dados que poderá ser acessado por uma ferramenta web de uso institucional.

Situação: concluído Data de Início: Sat Jul 01 00:00:00 GMT-03:00 2017 Data de Finalização: Sun Jun 30 00:00:00 GMT-03:00 2019

Unidade Lider: Embrapa Agricultura Digital

Líder de projeto: Mauricio de Alvarenga Mudadu

Contato: mauricio.mudadu@embrapa.br