Bases para a implementação de seleção genômica em Brachiaria

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Foto: Carvalho, Arminda Moreira de

Uma nova cultivar forrageira pode levar até 15 anos para ser desenvolvida. A seleção genômica surgiu como alternativa para a seleção assistida por marcadores em características complexas. A implementação de um programa de seleção genômica em uma espécie de interesse demanda um grande número de marcadores moleculares de baixo custo de genotipagem e o delineamento de uma população de treinamento adequada para a cultura. O objetivo do projeto foi desenvolver as bases para aplicação de seleção genômica no programa de melhoramento genético de Urochloa ruziziensis diplóide (syn. Brachiaria ruziziensis). O projeto desenvolveu um banco de dados de 10.189.604 variantes simples (SNPs) de alta qualidade, distribuídas nos 9 cromossomos do genoma de referência de Urochloa ruziziensis, pelo sequenciamento em plataforma Illumina de pools de indivíduos (pool-seq) e uso de um pipeline iterativo de recalibração implementado com o Genome Analysis Toolkit (GATK). Em paralelo, foi desenvolvida uma população de treinamento de U. ruziziensis representativa da diversidade genética disponível para a espécie no Brasil, constituída de 250 famílias de meios-irmãos. A população de treinamento será fenotipada e genotipada em projetos já em andamento, com financiamento da Embrapa. O projeto ampliou o conjunto de recursos genômicos disponíveis para U. ruziziensis, dando continuidade a uma linha de pesquisa impulsionada em projeto anterior (Sequenciamento e montagem do genoma de Brachiaria ruziziensis, potencial espécie modelo para gramíneas forrageiras), que permitiu a obtenção de um genoma de referência em escala cromossômica para espécie. Os SNPs descobertos podem ser testados e transferidos para outras espécies do gênero também utilizadas como forrageiras tropicais.Projeto cofinanciado: FAPDF (0193.001.740/2017)

Situação: concluído Data de Início: Sun Jul 01 00:00:00 GMT-03:00 2018 Data de Finalização: Tue Jun 30 00:00:00 GMT-03:00 2020

Unidade Lider: Embrapa Cerrados

Líder de projeto: Marco Aurélio Caldas de Pinho Pessoa Filho

Contato: marco.pessoa@embrapa.br

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