A utilização de matérias primas alternativas para a produção do biodiesel possui grande potencial para diversificar o agronegócio no país, mas está associado a um risco que o produtor não pode assumir. Este risco é resultado principalmente do incipiente grau de domesticação dos novos cultivos que estão sendo aventados para a produção de biodiesel e da perspectiva de abertura de mercado para a comercialização destas matérias-primas. O projeto é resultado de parcerias interna e externa entre a Embrapa Rondônia, a Embrapa Agropecuária Oeste e a Fundação Universidade Federal de Rondônia, visando desenvolver os componentes tecnológicos essenciais para a domesticação do pinhão-manso no estado ( Jatropha curcas) e coletar informações para caracterizar outras fontes de matéria-prima da biota amazônica, tais como, a pupunha ( Bactris gasipaes), o babaçu, ( Attalea speciosa), a andiroba ( Carapa guianensis), o buriti ( Mauritia flexuosa) e o inajá ( Maximiliana maripa) para produção de biodiesel.