O projeto Caracterização molecular de germoplasma do complexo babaçu analisou 122 acessos que distribuíram-se em 7 grupos de similaridade. A menor similaridades obtida foi de 22% entre o acesso BRA 850/1-7/4 coletado em Vanderlândia-GO e o acesso BRA 086/15 coletado em Balsas-MA e o acesso BRA 094/12 coletado em Teresina-PI e BRA 0442/8-2/3 coletado em Nuflo Chaves-BO. Foi observado que a variabilidade genética presente no BAG de babaçu ocorre predominantemente dentro das populações (68,14%), enquanto 31,86% é proveniente da diferença entre populações, pelo GST obtido de 0.31858 conclui-se que há um alto nível de diferenciação genética em todas as 15 populações de babaçu analisadas. A identificação de acessos divergentes como BRA 850 /1-7-14, BRA 86/15, BRA 094/2 e BRA 442/8-2/3 vislumbra a possibilidade de obtenção de populações segregantes em programas de melhoramento. Além de serem fontes de alelos que não estão presentes em outros acessos.