Caracterização molecular do banco de germoplasma de mandioca da Embrapa Amazônia Oriental por meio de marcadores microssatélites
Caracterização molecular do banco de germoplasma de mandioca da Embrapa Amazônia Oriental por meio de marcadores microssatélites
A mandioca é uma cultura de destaque para o Estado do Pará, não apenas pela importância que tem na alimentação do paraense, mas por representar uma fonte de renda a milhares de agricultores. A cultura também pode dar suporte a agroindústria paraense, com o fornecimento de matéria-prima para a fabricação de diversos produtos. Para que a cultura da mandioca possa ser incrementada no Estado do Pará, é necessário o seu melhoramento genético, visando à obtenção de materiais mais adaptados, mais produtivos e com tolerância a doenças e pragas. O banco de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental contém 476 acessos de mandioca, incluindo acessos de mandiocaba, macaxeira e mandioca brava. Esse banco serve de base para o melhoramento genético da cultura e para que seja mais bem aproveitado, a sua caracterização molecular é essencial. O uso de marcadores microssatélites é recomendado para esse propósito, pois é um marcador bastante informativo e polimórfico, e é capaz de diferenciar genótipos altamente relacionados.
Dessa forma, este projeto propõe a caracterização molecular do total de acessos de mandioca por meio de marcadores microssatélites. De posse dos dados gerados a partir da genotipagem molecular, serão estimados parâmetros de diversidade total para o banco e para grupos estabelecidos por tipo de mandioca e por local de origem dos acessos. Será verificada a diferenciação genética entre e dentro dos grupos, e serão verificados parâmetros como frequência alélica, equilíbrio de Hardy-Weinberg, conteúdo de informação polimórfica por loco, proporção de locos polimórficos, número total e médio de alelos por loco, número efetivo de alelos por loco polimórfico, proporção de alelos contidos em cada grupo, número de alelos raros, riquezas genotípica e alélica. Serão verificadas as medidas de identidade genética entre e dentro dos grupos, assim como as medidas observadas de heterozigosidade entre e dentro dos grupos de acessos de mandioca. A partir dessas medidas, será estimada a diferenciação entre os grupos. Serão calculadas as estatísticas F de Wright, calculadas a partir das medidas de heterozigosidade. A obtenção das dissimilaridades genéticas e a construção dos dendrogramas servirão para identificar duplicatas, verificar a relação entre os acessos e selecionar genitores promissores para cruzamentos. /n
Dessa forma, este projeto propõe a caracterização molecular do total de acessos de mandioca por meio de marcadores microssatélites. De posse dos dados gerados a partir da genotipagem molecular, serão estimados parâmetros de diversidade total para o banco e para grupos estabelecidos por tipo de mandioca e por local de origem dos acessos. Será verificada a diferenciação genética entre e dentro dos grupos, e serão verificados parâmetros como frequência alélica, equilíbrio de Hardy-Weinberg, conteúdo de informação polimórfica por loco, proporção de locos polimórficos, número total e médio de alelos por loco, número efetivo de alelos por loco polimórfico, proporção de alelos contidos em cada grupo, número de alelos raros, riquezas genotípica e alélica. Serão verificadas as medidas de identidade genética entre e dentro dos grupos, assim como as medidas observadas de heterozigosidade entre e dentro dos grupos de acessos de mandioca. A partir dessas medidas, será estimada a diferenciação entre os grupos. Serão calculadas as estatísticas F de Wright, calculadas a partir das medidas de heterozigosidade. A obtenção das dissimilaridades genéticas e a construção dos dendrogramas servirão para identificar duplicatas, verificar a relação entre os acessos e selecionar genitores promissores para cruzamentos. /n
Ecossistema: Amazônico
Situação: concluído Data de Início: Sun Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2010 Data de Finalização: Tue Jul 31 00:00:00 GMT-03:00 2012
Unidade Lider: Embrapa Amazônia Oriental
Líder de projeto: Elisa Ferreira Moura Cunha
Contato: elisa.moura@embrapa.br
Palavras-chave: Manihot esculenta, marcadores moleculares, recursos genéticos