Estudo filogenético da diversidade do gênero Bradyrhizobium por MLSA e utilização desta técnica para designar possíveis novas espécies.

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Author(s): HELENE, L. C. F.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M.

Summary: Bactérias simbióticas fixadoras de nitrogênio, também chamadas popularmente de rizóbios, têm grande relevância agronômica, pois fornecem quantidades significativas de N para as plantas e colaboram para a recuperação de solos e ambientes degradados. Nos últimos anos, com o avanço das técnicas moleculares e das análises genéticas, diversos trabalhos têm demonstrado que essas bactérias apresentam uma elevada diversidade genética, resultando em reclassificações taxonômicas e na descrição de novas espécies. Apesar do gene ribossomal 16S (16S RNAr) ainda ser utilizado em análises filogenéticas de procariotos, sua alta conservação não é capaz de revelar diferenças entre espécies de diversos gêneros, incluindo Bradyrhizobium. Outras metodologias, como o MLSA (Multilocus Sequence Analysis), estão sendo utilizadas para elucidar esses casos, com bons resultados. Neste trabalho, 15 estirpes de Bradyrhizobium sem posicionamento taxonômico claro foram utilizadas em estudos de filogenia e taxonomia com base na técnica de MLSA. Para isso, quatro genes housekeeping foram sequenciados, resultando em uma sequência concatenada, que foi utilizada para a construção de uma árvore filogenética, que foi comparada com a árvore do gene 16S RNAr. Das 15 estirpes, oito agruparam com a espécie B. pachyrhizi, enquanto as SEMIAS 6159 e 6480 ocuparam posições isoladas, e dois grupos (SEMIAS 6399 e 6404, e SEMIAS 690, 1153 e 1190) não apresentaram semelhança genética com nenhuma espécie descrita. Esses grupos merecem estudos mais detalhados, pois apresentam grande potencial de representarem espécies novas. As estirpes SEMIAS 690, 1153 e 1190 foram selecionadas para estudos visando a descrição de uma nova espécie, tendo início um estudo polifásico (análises genéticas, fenotípicas e filogenéticas). Dos resultados obtidos até o presente momento, o perfil de BOX-PCR agrupou as estirpes com mais de 73% de similaridade entre si, e inferiores a 66% com as espécies já descritas. Os testes fenotípicos (fontes de carbono, testes morfológicos, condições de crescimento) são congruentes entre as estirpes representantes das novas espécies e as demais análises necessárias para descrição de espécies procarióticas estão em andamento. Os resultados obtidos confirmam que a técnica de MLSA é eficiente para estudos filogenéticos de procariotos, mostrando ser uma forma segura e rápida de análise da diversidade dos gêneros e identificação de possíveis novas espécies.

Publication year: 2014

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