Author(s): CARDOSO, C. C.; SILVA, E. C. da; PIMENTEL, C. M.; CAETANO, A. R.; FACO, O.; PAIVA, S. R.

Summary: Resumo: Este trabalho teve como objetivo em avaliar seis locos para confirmação de paternidade do Teste de Progênie do programa de melhoramento de caprinos leiteiros. 103 amostras de DNA genômico de animais pertencentes a três raças caprinas (Saanen, Anglo Nubiana e Alpina) foram usadas. Foram testados nove marcadores moleculares para o teste de paternidade: INRA05, TCRVB6,SRCRSP9, INRA63, MAF65 e MCM527. Os fragmentos amplificados foram separados em sequenciador automático, ABI Prism 3100 (AppliedBiosystems) e os dados foram analisados com o software Genotyper v. 3.7.0.1 (AppliedBiosystems) para identificação dos genótipos. Foi utilizado o software Cervus v. 3.0.3 para obtermos a o número de alelos (K), heterozigosidades observada (Ho) e esperada (He), conteúdo de informação polimórfica (PIC), duas probabilidades de exclusão (P e PE2) para cada loco. Os seis locos do presente estudo amplificaram fragmentos polimórficos nas três raças avaliadas. O número de alelos encontrados foi entre cinco e 13 locos. O maior valor obtido de PIC foi o SRCRSP9 (0,86), mas o loco INRA05 apresentou a maior probabilidade de exclusão 0,84.O teste de exclusão de paternidade foi confirmado, já que foi obtida uma alta taxa de exclusão. A porcentagem de acerto no teste de paternidade foi de 47,82% para pares (suposto pai e produto) e de 39,02% para trios (suposto pai, matriz e produto). Para uma maior probabilidade de exclusão deverão ser acrescentados outro locos para um teste mais confiável. [Paternity test with molecular markers in breeding program of dairy goats]. Abstract: This study aimed to evaluate six loci for paternity confirmation in animals from the Dairy Goat Breeding Program Progeny Test. 103 genomic DNA samples of animals belonging to three goat breeds (Saanen, Anglo Nubian and Alpine) were used in this work. Six different molecular markers were used for paternity testing: INRA05, TCRVB6,SRCRSP9, INRA63, MAF65 e MCM527. The amplified fragments were separated in an automated sequencer, ABI PRISM 3100 (Applied Biosystems) and data were analyzed with the Genotyper software v. 3.7.0.1 (Applied Biosystems) to identify the genotypes. Cervus v. 3.0.3 software was used to obtain the number of alleles (K), observed (Ho) and expected (He) heterozygosity, polymorphic information content (PIC), two exclusion probabilities (PE1 and PE2) for each locus. The six loci amplified in this study were polymorphic in the three breeds studied. The number of alleles per locos varied from five to thirteen. The highest value obtained for PIC was for the SRCRSP9 locus (0.86) but INRA05 had the highest exclusion probability of 0.84.The markers tested for paternity exclusion was confirmed, since they had a high rate of exclusion. The percentage of success in paternity test was 47.82% for pairs (alleged father and product) and 39.02% for trios (alleged father, mother and product). For a greater probability of exclusion should be added to other loci for a paternity test more reliable.

Publication year: 2012

Types of publication: Abstract in annals or event proceedings

Unit: Embrapa Goats & Sheep

Keywords: Animal genetics, Capra Hircus, Caprino, Genetic markers, Genética animal, Goats, Marcador molecular, Marcadores moleculares, Microsatellites, Microssatélite, Microssatélites, Paternidade, Paternity tests