Caracterização de bactérias antagonistas com alto potencial de inibição do crescimento de Thielaviopsis paradoxa quanto à presença de genes para síntese de policetídeos e peptídeos não-ribossomais.
Caracterização de bactérias antagonistas com alto potencial de inibição do crescimento de Thielaviopsis paradoxa quanto à presença de genes para síntese de policetídeos e peptídeos não-ribossomais.
Author(s): FRAGA, Y. S. B.; SANTOS, D. R. dos; REGO, R.; BRANDÃO, É. C. T. dos A.; DINIZ, L. E. C.; FERNANDES, M. F.
Summary: O solo é um ambiente estruturalmente complexo constituindo um importante reservatório da diversidade microbiana. Grande parte desta diversidade ainda permanece desconhecida, uma vez que a maioria dos micro-organismos não são recuperados e cultivados por técnicas convencionais. Bactérias do solo representam uma fonte abundante de compostos biologicamente ativos, que têm sido associados às vias metabólicas da sintase policetídeo e da sintetase peptídeo não-ribossomal. O objetivo deste estudo foi identificar, por meio de sequenciamento do gene 16S DNAr, 84 isolados de uma coleção de bactérias com potencial de inibição de fungos fitopatógenos e caracterizar os isolados com maiores potenciais de inibição de T. paradoxa quanto à presença de genes relacionados à síntese de policetídeos e de peptídeos não-ribossomais, compostos de elevada atividade biológica. A afiliação taxonômica dos isolados antagonistas foi realizada com base nas sequências parciais do gene RNAr 16S. O DNA extraído foi amplificado por PCR utilizando os primers 27F e 1488R (ADERIBIGBE et al., 2011). As sequências parciais do gene RNAr 16S obtidas foram comparadas às sequências de bactérias de cultura-tipo depositadas nas bases de dados do GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) utilizando o programa BLASTN (ALTSCHUL et al., 1997). Os isolados selecionados foram submetidos à pesquisa de genes PKS-1 e NRPS. Para isto, foi realizada a amplificação por PCR de sequências conservadas a partir da utilização de primers degenerados específicos descritos na literatura (PARSLEY et al., 2011; SACIDO; GENNILOUD, 2005). A pesquisa dos genes funcionais mostrou que o gene NRPS apresentou efeito significativo (p<0,05) em relação à inibição do crescimento do Thielaviopsis paradoxa, demonstrando a associação deste gene à atividade antagônica frente ao fitopatógeno. Bactérias obtidas de solos supressivos a fusariose coletados em Pernambuco, que apresentam potencial antagonista ao fungo fitopatogênico Thielaviopsis paradoxa, pertencem predominantemente à família Bacillaceae. Diversos estudos da literatura afirmam que Bacillus spp. predominam entre os gêneros bacterianos com potencial antagonista contra fitopatógenos diversos, o que corrobora com os resultados obtidos neste estudo.
Publication year: 2015
Types of publication: Paper in annals and proceedings
Observation
Some of Embrapa's publications are published as ePub files. To read them, use or download one of the following free software options to your computer or mobile device. Android: Google Play Books; IOS: iBooks; Windows and Linux: Calibre.
Access other publications
Access the Agricultural Research Database (BDPA) to consult Embrapa's full library collection and records.
Visit Embrapa Bookstore to purchase books and other publications sold by Embrapa.