Genetic Diversity and Structure of Ruzigrass Germplasm Collected in Africa and Brazil.
Genetic Diversity and Structure of Ruzigrass Germplasm Collected in Africa and Brazil.
Author(s): PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; AZEVEDO, A. L. S.; SOUZA SOBRINHO, F. de; GOUVEA, E. G.; MARTINS, A. M.; FERREIRA, M. E.
Summary: ABSTRACT: Ruzigrass [Urochloa ruziziensis (r. Germain & Evrard) Crins, syn. Brachiaria ruziziensis Germain & Evrard] is a tropical forage native to Africa, f irst introduced in Brazil in the 1960s. ruzigrass is diploid, presents sexual reproduction, and is a model species for the generation of genomic resources in the Brachiaria genus. Brachiaria species are the most important livestock forage in the tropics, covering more than 70 million ha in Brazil alone. We have used multiplex panels of microsatellite markers to characterize the genetic diversity of ruzigrass germplasm collected in Africa, and of a local population collected in Brazil, to obtain information for its conservation and use in breeding programs. Fifteen SSr markers were used to Genotype 114 ruzigrass samples. Summary statistics, as well as estimates of FST and partitioning of genetic diversity were obtained. Clustering and genetic structure analyses were performed. results showed high values of heterozygosity in the African and Brazilian populations. Although African and Brazilian samples formed distinct groups in clustering analyses, and Bayesian analysis of genetic structure distributed samples into three clusters, estimates of pairwise FST values showed no differentiation between African and Brazilian groups of samples. results indicated that the introduction of ruzigrass in Brazil did not cause a major decrease in genetic diversity. Brazilian local populations might harbor favorable alleles that will be useful for ongoing and future breeding programs. They offer great opportunities for ruzigrass germplasm collection and conservation of genetic diversity, before attempts to access germplasm in its center of diversity are undertaken. RESUMO: Ruzigrass [Urochloa ruziziensis (r. Germain & Evrard) Crins, syn. Brachiaria ruziziensis Germain & Evrard] é uma forragem tropical nativa da África, introduzida pela primeira vez no Brasil na década de 1960. Ruzigrass é diploide, apresenta reprodução sexuada e é uma espécie modelo para a geração de recursos genômicos no gênero Brachiaria. As espécies de Brachiaria são as forragens mais importantes para o gado nos trópicos, cobrindo mais de 70 milhões de ha somente no Brasil. Utilizamos painéis multiplex de marcadores microssatélites para caracterizar a diversidade genética do germoplasma de ruzigrass coletado na África e de uma população local coletada no Brasil, para obter informações para sua conservação e uso em programas de melhoramento. Quinze marcadores RSS foram usados ??para genotipar 114 amostras de ruzigrass. Estatísticas de resumo, bem como estimativas de FST e partição da diversidade genética foram obtidas. Análises de agrupamento e estrutura genética foram realizadas. Os resultados mostraram altos valores de heterozigosidade nas populações africana e brasileira. Embora as amostras africanas e brasileiras tenham formado grupos distintos em análises de agrupamento, e a análise bayesiana da estrutura genética tenha distribuído as amostras em três grupos, as estimativas dos valores de FST pareados não mostraram diferenciação entre os grupos africanos e brasileiros de amostras. Os resultados indicaram que a introdução do ruzigrass no Brasil não causou uma grande diminuição na diversidade genética. As populações locais brasileiras podem abrigar alelos favoráveis ??que serão úteis para programas de melhoramento em andamento e futuros. Eles oferecem grandes oportunidades para coleta de germoplasma de ruzigrass e conservação da diversidade genética, antes que tentativas de acessar o germoplasma em seu centro de diversidade sejam realizadas.
Publication year: 2015
Types of publication: Journal article
Unit: Embrapa Cerrados
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