Otimização de iniciadores (primers) de loci microssatélites obtidos a partir do transcritoma de Urochloa decumbens.

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Author(s): DÉO, T. G.; LEGUIZAMÓN, A. C.; VILELA, M. M.; SALGADO, L. R.; CHIARI, L.

Summary: Urochloa decumbens (Sinonímia Brachiaria decumbens) é conhecida pela sua alta produtividade e adaptabilidade em solos ácidos e de baixa fertilidade. Apesar de destaque na pecuária de corte nacional, estudos genéticos sobre a espécie ainda são um fator limitante para os programas de melhoramento genético, uma vez que a reprodução prevalecente é a apomítica e os indivíduos podem se apresentar de diploides a pentaploides. A recente técnica de RNA-Seq utilizada para sequenciamento de transcritomas, proporciona a identificação de marcadores moleculares do tipo microssatélites presentes em regiões funcionais do genoma, relacionados a características agronômicas importantes o que pode levar a maior eficiência em programas de melhoramento genético. O objetivo deste estudo foi otimizar as condições de amplificação de pares de primers de loci microssatélites obtidos a partir do transcritoma de U. decumbens, para posterior caracterização em géis de poliacrilamida. Para isto, foi extraído o DNA de quatro plantas do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Gado de Corte, sendo duas diploides e duas tetraploides, e estes foram usados para otimização de 100 pares de primers, por meio da amplificação da região microssatélite via PCR (Reação em Cadeia da Polimerase).

Publication year: 2016

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