Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora.
Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora.
Autoria: CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C.
Resumo: A produção mundial de café é altamente afetada pelas mudanças climáticas, consequentemente, obter plantas adaptadas a este cenário de clima alterado torna-se muito importante. Com os recentes avanços na genômica do cafeeiro, como o sequenciamento do genoma de C. canephora, o objetivo deste trabalho foi desenvolver e validar o chip de genotipagem de DNA para C. canephora (26K Axiom SNP array), visando uma plataforma de genotipagem confiável e de alto rendimento, a ser utilizada nos programas de melhoramento da espécie. A construção do chip foi feita utilizando-se dados gerados a partir do resequenciamento genômico de pools formados por indivíduos dos diferentes grupos de diversidade encontrados na espécie e por indivíduos de C. canephora Conilon, pertencentes aos principais programas de melhoramento no Brasil. Este painel de resequenciamento foi escolhido visando cobrir a maior parte da diversidade genética presente na espécie estudada.
Ano de publicação: 2017
Tipo de publicação: Anais e Proceedings de eventos (considerados no todo)
Palavras-chave: Coffea canephora, DNA, Gene, Genoma, Genotipagem, Melhoramento genético, SNP array
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