Author(s): GUIMARÃES, P. de S.; SCHENK, J. C. M.; GIACHETTO, P. F.; PADILHA, L.; SILVAROLLA, M. B.; MALUF, M. P.

Summary: RESUMO: A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos e de redes metabólicas associadas aos teores de cafeína. Para a validação das análises in silico, selecionamos 3 genes de famílias de retrotransposons para análises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeína (AC), tanto em condições normais quanto durante déficit hídrico. O perfil de expressão dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas análises de RNAseq. Além disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hídrico, uma vez que a expressão de retrotransposons é mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN.

Publication year: 2019

Types of publication: Paper in annals and proceedings

Unit: Embrapa Digital Agriculture

Keywords: Assisted-selection, Expressão gênica, Melhoramento molecular, Molecular breeding, Plantas sem cafeína, RNAseq, Seleção-assistida, Sequenciamento de RNA, Sequenciamento de transcriptoma