Transferibilidade de marcadores microssatélites desenvolvidos a partir de RNA-Seq de amendoim forrageiro.

Enter multiple e-mails separated by comma.

imagem

Author(s): OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; SILVA, L. M. da; CAMPOS, T. de

Summary: O amendoim forrageiro (Arachis pintoi) apresenta destaque expressivo que traduz a sua importância econômica e ambiental em pastagens. Porém, ainda são poucas as variedades disponíveis para cultivo. O uso de marcadores moleculares baseados em RNA-Seq é vantajoso, pois são derivados de genes que podem estar relacionados com características fenotípicas de interesse agronômico. Assim, o objetivo deste trabalho foi testar a transferibilidade de marcadores microssatélites desenvolvidos a partir de RNA-Seq de Arachis pintoi para Arachis repens e o amendoim comum (Arachis hypogaea L.). Trinta e três locos microssatélites foram analisados, dos quais 28 apresentaram amplificação em todas as espécies. Tal resultado indica que esses locos são altamente conservados. A maior taxa de transferibilidade foi observada em A. repens (100%), espécie pertencente à mesma secção taxonômica que A. pintoi. Cinco locos amplificaram apenas em A. repens. Isso sugere alterações nas regiões flanqueadoras dos locos em A. hypogaea, impedindo o anelamento correto dos primers. Em A. hypogaea a taxa foi de 84,85%. A anotação funcional dos locos identificou similaridade com proteínas relacionadas ao crescimento, desenvolvimento e diferenciação de células e tecidos, e resistência a patógenos. Esses dados indicam o potencial informativo dos novos locos e podem ser usados em programas de melhoramento.

Publication year: 2021

Types of publication: Paper in annals and proceedings

Unit: Embrapa Acre

Observation

Some of Embrapa's publications are published as ePub files. To read them, use or download one of the following free software options to your computer or mobile device. Android: Google Play Books; IOS: iBooks; Windows and Linux: Calibre.

 


Access other publications

Access the Agricultural Research Database (BDPA) to consult Embrapa's full library collection and records.
Visit Embrapa Bookstore to purchase books and other publications sold by Embrapa.