Genomic signatures for drylands adaptation at gene-rich regions in African zebu cattle.
Genomic signatures for drylands adaptation at gene-rich regions in African zebu cattle.
Autoria: TIJJANI, A.; SALIM, B.; SILVA, M. V. G. B.; ELTAHIR, H. A.; MUSA, T. H.; MARSHALL, K.; HANOTTE, O.; MUSA, H. H.
Resumo: Background - Indigenous Sudanese cattle are mainly indicine/zebu (humped) type. They thrive in the harshest dryland environments characterised by high temperatures, long seasonal dry periods, nutritional shortages, and vector disease challenges. Here, we sequenced 60 indigenous Sudanese cattle from six indigenous breeds and analysed the data using three genomic scan approaches to unravel cattle adaptation to the African dryland region. Results - We identified a set of gene-rich selective sweep regions, detected mostly on chromosomes 5, 7 and 19, shared across African and Gir zebu. These include genes involved in immune response, body size and conformation, and heat stress response. We also identified selective sweep regions unique to Sudanese zebu. Of these, a 250 kb selective sweep on chromosome 16 spans seven genes, including PLCH2, PEX10, PRKCZ, and SKI, which are involved in alternative adaptive metabolic strategies of insulin signalling, glucose homeostasis, and fat metabolism. Conclusions - Our results suggest that environmental adaptation may involve recent and ancient selection at generich regions, which might be under a common regulatory genetic control, in zebu cattle.
Ano de publicação: 2022
Tipo de publicação: Artigo de periódico
Unidade: Embrapa Gado de Leite
Palavras-chave: Adaptação ao deserto, Gado Zebu, Insulina, Metabolismo Animal, Zebu africano, Zebu sudanês
Observações
1 - Por padrão são exibidas publicações dos últimos 20 anos. Para encontrar publicações mais antigas, configure o filtro ano de publicação, colocando o ano a partir do qual você deseja encontrar publicações. O filtro está na coluna da esquerda na busca acima.
2 - Para ler algumas publicações da Embrapa (apenas as que estão em formato ePub), é necessário ter, no celular ou computador, um desses softwares gratuitos. Sistemas Android: Google Play Livros; IOS: iBooks; Windows e Linux: software Calibre.
Acesse outras publicações
Acesse a Base de Dados da Pesquisa Agropecuária (BDPA) para consultar o acervo completo das bibliotecas da Embrapa.