Perfil comparativo do transcriptoma em Psidium guajava L. e Psidium friedrichsthalianum fornece expressão gênica em resposta à resistencia ao Meloidogyne enterolobii.
Perfil comparativo do transcriptoma em Psidium guajava L. e Psidium friedrichsthalianum fornece expressão gênica em resposta à resistencia ao Meloidogyne enterolobii.
Author(s): COSTA, S. N. de O.; ANDRADE, F. de L.; SILVA, L. F. da; ARAÚJO, P. M.; RIBEIRO, J. M.; CASTRO, J. M. da C. e; MATOS, C. G. G. de; SCORTECCI, K. C.; SALES. K. V.
Summary: A goiabeira (Psidium guajava L.), espécie tropical da América do Sul, é considerada uma frutífera de relevância econômica no Brasil. Entretanto, interações sinérgicas entre o nematoide Meloidogyne enterolobii e o fungo Fusarium solani nas raízes destas lantas acarretam a formação de galhas e apodrecimento das raízes. Nesse contexto, P. friedrichsthalianum (Araçá Costa Rica) foi identificada como espécie resistente ao nematoide. Para melhor entender a relação de suscetibilidade e resistência à infecção por M. enterolobii, foi realizado o sequenciamento do transcriptoma de folhas das espécies P. guajava L. e P. friedrichsthalianum (de plantas controle e de plantas inoculadas com o nematoide) pela metodologia de RNA-seq, seguida pela montagem de sequências. Foram obtidos 60.836 contigs com N50 de 786 pb utilizando o sequenciador ILLUMINA (Illumina HiSeq 2000). As transcrições foram anotadas via Genomes Kyoto (KEGG) e Gene Ontology (GO). Para as quatro bibliotecas disponibilizadas no NCBI (National Center for Biotetchnology Information) sob acesso PRJNA779437, realizou-se o mapeamento comparativo com o genoma de Eucalyptus grandis v2.0, por meio de ferramentas de bioinformática. Considerando os genes que possuem anotação no Phytozome e com expressão acima de 50 TPM, construíram-se um heatmap e uma rede de interação do tipo interactoma, com 68 genes. Desses, 21 estão intimamente relacionados à regulação dos fotossistemas I e II. Os demais estão envolvidos na produção de clorofila, rubisco e cadeia transportadora de elétrons. Também verificou-se alteração da expressão gênica relacionada às enzimas do estresse oxidativo, com redução de catalase, peroxidase e tiredoxina (mRNA splicing) em plantas de P. guajava inoculadas e aumento das mesmas enzimas em P. friedrichsthalianum na mesma condição. Com isso, sugere-se a ocorrência de um efeito sistêmico nas folhas de Psidium spp. como resposta à infecção nas raízes, refletido por alterações nas vias fotossintéticas. Adicionalmente, também ocorre alteração da expressão de genes relacionados ao metabolismo fenólico, atuante na defesa de plantas contra os estresses bióticos e abióticos
Publication year: 2023
Types of publication: Abstract in annals or event proceedings
Unit: Embrapa Semi-arid Region
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