Summary: Objetivou-se neste estudo avaliar melhorias na acurácia de imputação em animais Canchim e do grupo genético MA com a incorporação de genótipos de animais Nelore e Charolês. Foram testados oito cenários de imputação, em que os genótipos de alta densidade foram reduzidos para a densidade do painel BovineSNP50 BeadChip (50K) com capacidade de 54.609 SNPs apenas para a população alvo (CA e MA). A população de referência (Nelore e Charolês) permaneceu com genótipos em alta densidade. Foi determinada a acurácia de imputação por meio da taxa de concordância e quadrado de correlação alélica. Variações foram observadas quanto ao número de marcadores após o controle de qualidade dos genótipos em cada cenário. Os cenários C5 e C7 mostraram a maior acurácia pela contribuição do maior parentesco entre populações de animais CA e do grupo genético MA, e o C2 baixa acurácia de imputação devido ao tamanho inferior da população referência. Concluiu-se que a utilização de genótipos das raças fundadoras promove aumento na acurácia para os animais CA e MA, podendo reduzir os custos de genotipagem em raças compostas. A inclusão da raça Charolês como parte da população referência, em conjunto com animais CA, resulta nos maiores ganhos em acurácia.

Publication year: 2023

Types of publication: Journal article

Unit: Embrapa Southeastern Livestock