Desenvolvimento de um aplicativo web para a busca comparativa de genes de miRNAs e genes alvos de miRNAs específicos de plantas.
Desenvolvimento de um aplicativo web para a busca comparativa de genes de miRNAs e genes alvos de miRNAs específicos de plantas.
Author(s): FLATSCHART, A. V. F.; RIBEIRO, R. de S.; FLATSCHART, R. B.; CASTRO, S. Z.; PEREIRA, R. de A.; CARVALHO, B. P. R. de; FIGUEIREDO, J. E. F.
Summary: Neste trabalho é descrita a construção de uma base de dados de miRNAs de plantas e o desenvolvimento de uma ferramenta de buscas que permite a localização de possíveis seqüências alvos em genes de plantas, a comparação de miRNAs em diferentes espécies vegetais e a identificação de novos miRNAs nestes organismos. No aplicativo Web desenvolvido, as buscas são feitas, com auxílio do programa BLASTN, em uma base de dados de miRNAs específicos de plantas construída a partir da filtragem de bases pré-existentes. Entre outras aplicações, a nova base de dados e a ferramenta de busca poderão ser úteis no estudo comparativo e evolutivo dos miRNAs de plantas e sua possível contribuição na diversidade fenotípica das plantas.
Publication year: 2009
Types of publication: Paper in annals and proceedings
Unit: Embrapa Maize & Sorghum
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