Building multiple sequence alignments with a flavor of HSSP alignments.

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Autoria: HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B. da; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FILETO, R.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; MANCINI, A. L.; NESHICH, G.

Resumo: The present study describes the processing used for building SH2QS as well as a comparison of the degree of residue conservation reported by SH2QS and HSSP. The comparison of the profiles from two alignments is also presented.

Ano de publicação: 2006

Tipo de publicação: Artigo de periódico

Unidade: Embrapa Agricultura Digital

Palavras-chave: Bioinformatics, Bioinformática, Estrutura secundária de proteínas, Multiple sequence alignment, Protein secondary structure, Protein structure, Relative entropy, Residue conservation, Sting

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