Validação de marcadores SSR para estudos de diversidade genética de Fusarium oxysporum f. sp. Cubense.
Validação de marcadores SSR para estudos de diversidade genética de Fusarium oxysporum f. sp. Cubense.
Author(s): COSTA, S. N.; OLIVEIRA, L. S.; VELAME, D.; OLIVEIRA, S. A. S. de; AMORIM, E. P.; HADDAD, F.; BARBOSA, F. F. L.
Summary: O mal-do-Panamá, causado pelo fungo Fusarium oxysporum f. sp. cubense (FOC), é uma das doenças mais destrutivas da bananeira. A medida de controle mais efetiva é o uso de variedades resistentes. O surgimento de novas raças é preocupação constante e fator desafiador para os programas de melhoramento visando resistência à doença. O objetivo do estudo foi validar primers SSR, para posterior avaliação da estrutura populacional de FOC. Para tanto, nove iniciadores SSR foram utilizados em 15 isloados coletados em diferentes regiões produtoras de banana no Brasil. Dos nove oligonucleotídeos utilizados, quatro não amplificaram nas amostras analisadas. Desta forma, foram utilizados para as análises apenas cinco iniciadores. Os isolados foram agrupados pelo método UPGMA, com base na distância genética de Nei, tendo sido observada a formação de três grupos distintos. O primeiro grupo foi constituído nove indivíduos, o segundo composto por cinco isolados eo terceiro grupo com apenas um isolado (FOC 2010.05- Corupá- SC). Constatou-se por meio de variância molecular (AMOVA), que 89,2% da variação genética de FOC está associada a diferenças na frequência dos alelos nos locais de coleta. Os marcadores SSR testados foram eficientes em detectar polimorfismo e separar os isolados em grupos distintos, e serão utilizados para os estudos populacionais de Foc.
Publication year: 2012
Types of publication: Paper in annals and proceedings
Unit: Embrapa Cassava & Fruits
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