Author(s): ROSAS, M. R.; OLIVEIRA, M. do S. P. de; SANCHES, E. de N. M.; OLIVEIRA, N. P. de

Summary: Marcadores RAPD apresentam simplicidade, rapidez de resultados, baixo custo quando comprados a outros marcadores, demandam pequenas quantidades de DNA, sendo úteis em análises genéticas de espécies pouco conhecidas, como é o caso do tucumã-do-pará (Astrocaryum vulgare Mart.). Apesar de úteis a esse grupo de espécie são relatados como tendo pouca reprodutividade. Objetivou-se avaliar a reprodutibilidade de marcadores RAPD em germoplasma de tucumã-do-pará. Foram utilizadas cinco amostras de DNA de tucumã-do-pará, conservadas sob baixa temperatura no laboratório de genética molecular da Embrapa Amazônia Oriental, em testes de amplificação com cinco iniciadores RAPD da Operon Technologies, em três termocicladores com diferentes taxas de rampa. As reações foram preparadas para um volume final de 15 µl, para cada termociclador foram repetidas as mesmas reações. Os produtos amplificados foram aplicados em gel de agarose a 1% e separados por eletroforese horizontal. Compararam-se os perfis de géis e suas bandas amplificadas coincidentes para cada primer em cada equipamento para o cálculo da taxa de reprodutividade. O termociclador 3 apresentou a melhor nitidez e intensidade das bandas, o qual possui taxa de rampa de 5°C/s. A taxa de reprodutibilidade média foi de 47%. Os primers OPAB-01, OPAZ-04 e OPA-14 demonstraram as maiores reprodutibilidade com 57%, 55% e 52,14%, respectivamente. Os marcadores RAPD se mostram mais reproduzíveis em tucumã-do-pará utilizando equipamento com taxa de rampa de temperatura de 5°C/s.

Publication year: 2012

Types of publication: Paper in annals and proceedings

Unit: Embrapa Eastern Amazon

Keywords: Astrocaryum vulgare, Confiabilidade, Marcadores moleculares, Reprodução, Tucumã