Seleção de primers ISSR para uso em genomas de camucamuzeiro.

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Author(s): SILVA, M. R. da; OLIVEIRA, M. do S. P. de; MOURA, E. F.; RODRIGUES, S. de M.

Summary: Marcadores moleculares ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) tem padrão de herança dominante, sendo uma técnica rápida, simples e barata permitindo a sua aplicação em qualquer espécie se tornando mais uma ferramenta para análise de variabilidade genética de espécies vegetais. O camu camu (Myrciaria dúbia [H.B.K.] McVaugh) é uma espécie típica da região amazônica contendo elevado teor de ácido ascórbico e em vista de seu potencial às agroindústrias de polpa e de medicamentos alguns programas de melhoramento genético vem sendo estabelecido, onde após a seleção tem se clonado os indivíduos para avaliação em ensaios clonais em vários locais, mas o genoma desses clones tem sido pouco explorado. Este trabalho teve por objetivo selecionar primers ISSR para avaliar seus potenciais como marcadores moleculares em análise da diversidade genética entre clones selecionados para produção e teor de vitamina C. Foram utilizadas duas amostras de DNA escolhidas ao acaso entre os dez clones e progênies dessa espécie, sendo um clone e uma progênie, conservadas sob baixa temperatura no laboratório de genética molecular da Embrapa Amazônia Oriental. Foram testados 62 primers primeiramente em temperatura de anelamento de 47ºC para verificar a amplificação e depois em três gradientes. Foram selecionados os primers que apresentaram a melhor nitidez de bandas em suas respectivas temperaturas de anelamento. As reações de PCR foram realizadas em um mesmo termociclador sendo submetidas à eletroforese e os resultados fotodocumentados em UV.

Publication year: 2013

Types of publication: Paper in annals and proceedings

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