Programa computacional, baseado na versão original INTERGEN, desenvolvido em linguagem Fortran 90/95 com capacidade de implementar modelos hierárquicos de Bayes e estimar seus parâmetros por meio de métodos Monte Carlo via cadeias de Markov (MCMC) e dos melhores preditores lineares não viesados (BLUP). Esses modelos contemplam uma diversidade de situações abordadas em estudos de genética quantitativa, utilizando dados de desempenho de animais domésticos, incluindo: incerteza de paternidade, estrutura populacional com múltiplas composições raciais, interação genótipo-ambiente, heterogeneidade de variância residual e robustez a dados extremos.

Na versão 3 do software foi incluída sub-rotina para predição dos valores genéticos via BLUP, algoritmo é flexível o suficiente para ajustar modelos uni e multi-características, considerando homoscedasticidade de variância residual; sub-rotina para permitir a especificação de matrizes de (co)variância definidas pelo usuário, permitindo a implementação da seleção genômica; sub-rotina para ponderação do resíduo, permitindo que sejam aplicados diferentes pesos para as características; sub-rotina para permitir ao usuário a inclusão de uma informação a priori sobre o valor esperado (μP) e a variância (VP) dos efeitos fixos definidos no modelo, efeito normal prior; sub-rotina para o cálculo da inversa da variância de segregação mendeliana dos animais presentes no arquivo de pedigree, possibilitando que o usuário não tenha mais necessidade de informar esse valor no arquivo de pedigree; cálculo do fenótipo predito (ỹ=ÿ-ê), fenótipo ajustado (ỹ=y-Xb) e resíduo (ê) em análises BLUP. Apesar de permitir modelagem complexa, possui uma interface bastante simples, sistema desktop sendo acionado através de uma janela do Command Prompt do DOS no Windows ou terminal Linux/Mac OS e é controlado por um arquivo de parâmetros (“parameterfile”), o qual contém as informações sobre os arquivos de dados, de pedigree e outros arquivos definidos pelo usuário, sobre os efeitos no modelo e sobre o tipo de análise a ser implementada. O ativo tem como aplicação a predição de valores genéticos em programas de melhoramento genético em bovinos de corte.

Este ativo contribui com o Objetivo de Desenvolvimento Sustentável 2 (ODS 2) contido na agenda 2030, proposta pela Organização das Nações Unidas, cujo objetivo visa “garantir sistemas sustentáveis de produção de alimentos e implementar práticas agrícolas resilientes, que aumentem a produtividade e a produção, que ajudem a manter os ecossistemas, que fortaleçam a capacidade de adaptação às mudanças climáticas, às condições meteorológicas extremas, secas, inundações e outros desastres, e que melhorem progressivamente a qualidade da terra e do solo.

Benefícios:

Eficência na avaliação genética de bovinos de corte

Aplicação:

Melhoramento genético de bovinos de corte

Esta solução tecnológica foi desenvolvida pela Embrapa em parceria com outra(s) instituição(ões).