Um local conveniente para tratar animais doentes e examinar vacas para diagnóstico de gestação é, provavelmente, a área mais relegada a segundo plano num sistema de estabulação livre. As vacas são contidas nos estábulos convencionais, mas são difíceis de ser arrebanhadas e contidas nos sistemas de baias livres ( loose housing e free stall ). Há quatro tipos dessas áreas envolvidas no manejo de vacas doentes: 1) área de separação ou isolamento, b) área de tratamento, c) área de maternidade e de contenção, e d) área de pesagem e embarcadouro.

Área de isolamento

Destina-se a isolar animais para tratamento ou cuidados especiais. Cocho para alimentação e bebedouros de fácil limpeza são componentes essenciais desta área. Uma baia de 15 m², com capacidade para 3 (três) animais, é suficiente para um total de 100 vacas no rebanho. Estas baias devem ficar mais afastadas do restante das instalações para evitar contaminação, porém em posição estratégica, de fácil acesso e visualização dos empregados. É importante que as baias sejam confortáveis e ofereçam aos animais em tratamento condições adequadas de higiene e segurança.

Área de tratamento

Essa área é usada para inseminação artificial, exames ginecológicos pós-parto e diagnóstico de gestação. Para facilitar o manejo, deve ser localizada próximo à área de ordenha. O número de baias individuais para contenção deve ser igual ao número de baias existentes em um dos lados da sala de ordenha. Por exemplo, 6 (seis) baias para uma sala de ordenha tipo espinha-de-peixe 2 x 6 com 6 (seis) unidades. Normalmente, essa instalação deve ser localizada nas proximidades e na saída da sala de ordenha. Assim, os animais identificados e selecionados para tratamento no momento da ordenha serão encaminhados imediatamente a este local.

Área de maternidade

Nos sistemas de produção de leite a pasto, reserva-se um piquete provido de sombra, bebedouro e saleiro próximo às instalações principais, de fácil acesso, de boa topografia e boa visibilidade para a maternidade. Nos sistemas de confinamento, uma baia de 13 a 14 m² é suficiente para cada grupo de 25 vacas. O piso deve ser cimentado, ranhurado, para evitar que os animais escorreguem; nesse caso, é obrigatório o uso de cama. Cocho para fornecimento de alimentos volumosos e concentrados e bebedouro automático ou de nível devem ser projetados adequadamente.

Área de manejo

Área destinada à locação do conjunto: seringa, tronco (coletivo, individual ou ambos), balança e embarcadouro. O tipo de tronco a ser utilizado depende, especialmente, do número, do tipo de gado e do manejo preconizado para o sistema de produção. O dimensionamento desse conjunto de contenção deve ser bastante criterioso para evitar acidentes com os animais e com o homem. A cobertura ou sombreamento de parte ou de todo o conjunto é importante para dar mais durabilidade aos materiais e equipamentos, garantir conforto e melhores condições de trabalho, reduzindo o nível de estresse dos animais. As especificações técnicas e construtivas desses equipamentos são fornecidos pelos fabricantes.