O sistema de manejo "todos dentro, todos fora"  possibilita a limpeza e desinfecção completa das salas e a realização do vazio sanitário. Nas fases de cobrição e gestação, normalmente utiliza-se o sistema contínuo, sem realização de vazio sanitário. Por esta razão, para reduzir a contaminação do ambiente, deve-se lavar e desinfetar as baias ou boxes sempre que um lote de fêmeas for retirado.

A limpeza seca, com pá e vassoura na presença dos animais, deve ser feita diariamente de 1 a 3 vezes ao dia, dependendo do tipo de instalação.

• Iniciar a limpeza seca, com pá e vassoura, imediatamente após a retirada dos animais.

• Esvaziar as calhas ou fossas existentes.

• Desmontar e lavar todos os equipamentos da sala.

• Iniciar a limpeza úmida no máximo 3 horas após a saída dos animais.

• Umedecer previamente a instalação com água contendo um detergente para facilitar a remoção de toda a matéria orgânica aderida nas paredes e pisos.

• Fazer a limpeza úmida com lava jato de alta pressão (1000 a 2000 libras).

• Aplicar o desinfetante no dia seguinte ao da lavagem, com a instalação totalmente seca, usando cerca de 400ml da solução/m2 de superfície.

• Observar com cuidado a correta diluição do desinfetante, seguindo sempre a recomendação do fabricante.
• Desinfetar todas as superfícies da sala e todos os equipamentos.
• Nos meses de inverno, usar água pré aquecida a 37^oC para diluir o desinfetante.
• Opcionalmente pode ser feita uma segunda desinfeção, usando pulverização ou nebulização, cerca de duas horas antes do alojamento do próximo lote animais.
• No caso de sala de maternidade, fazer essa segunda desinfeção com vassoura de fogo (lança chamas), como medida auxiliar no controle da coccidiose.

• Aguardar vazio sanitário mínimo de 5 dias, deixando nesse período a sala fechada.
• Montar os equipamentos e alojar os animais na sala limpa e desinfetada.