As árvores de eucalipto apresentam-se normais ou sadias quando suas funções fisiológicas estão em plena atividade, de acordo com o potencial genético que possam expressar. As árvores tornam-se doentes quando uma ou várias de suas funções fisiológicas são alteradas pela ação de microrganismos patogênicos (fungos e bactérias) ou por determinadas condições adversas do ambiente. Inicialmente, a reação da planta frente ao microrganismo se concentra na região enferma. Porém, em pouco tempo, a reação se difunde e são produzidas modificações visíveis e que se constituem nos sintomas da doença.

Quando se verificam estruturas dos microrganismos patogênicos sobre a planta, como por exemplo, esporos, micélio (mofo) ou cogumelos, estes são denominados de sinais da doença.

As principais doenças encontradas em viveiros de mudas são:

• Tombamento de mudas;
• Mofo-cinzento;
• Podridão de estacas;
• Oídio;
• Ferrugem;
• Manchas foliares.

Em árvores e plantios comerciais de eucaliptos, são:

• Cancros na base da árvore e no tronco;
• Ferrugem;
• Manchas foliares.

As doenças causadas pelos fatores ambientais são resultado de mudanças extremas nas condições necessárias à vida da planta, como, por exemplo, a temperatura, a umidade e a luminosidade e nas quantidades de nutrientes minerais absorvidos ou requeridos pelas plantas, a saber:

• Queima por geada;
• Queda de granizo;
• Seca por déficit hídrico sazonal;
• Gomose e Pau-preto.

Em alguns casos, os problemas são originados na forma inadequada de plantar ou cultivar o eucalipto, como:

• Enterrio de mudas;
  
• Enovelamento de raízes.

Existem, ainda, a ocorrência de complexos etiológicos, normalmente iniciados por um fator(es) ambiental(ais) adverso(s) e tornam suscetíveis à infecção de organismos considerados como secundários no processo. Alguns dos complexos conhecidos são:

• Seca de ponteiros por falta de Boro;
• Seca de ponteiros do Vale do Rio Doce;
• Seca da saia do Eucalyptus viminalis.

Cada doença apresenta medidas de controle específicas em função do tipo de situação (viveiro ou campo) e do agente causal associado.