O programa de estágios da Embrapa Agricultura Digital visa contribuir para o desenvolvimento profissional dos estudantes. Para estagiar, os candidatos devem estar matriculados e frequentando cursos do Ensino Médio, Educação Profissional e Tecnológica, Ensino Superior ou Pós-Graduação.

A Unidade oferece vagas de estágio nas áreas de Pesquisa e de Suporte à Pesquisa. Na Pesquisa, as oportunidades de estágio concentram-se, principalmente, nas seguintes áreas: Novas Tecnologias, Geotecnologias, Modelagem Agroambiental, Inteligência Computacional, Software Livre, Organização da Informação Eletrônica, Redes de Computadores, Bioinformática e Matemática Computacional.

Já no Suporte à Pesquisa, as oportunidades de estágio concentram-se nas seguintes áreas: Gestão de Pessoas, Compras, Financeiro e Patrimonial, Manutenção Predial, Comunicação, Biblioteca, Suporte em TI e Transferência de Tecnologia.