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Identificação de CNVs em bovinos Canchim, a partir de dados de genotipagem de SNPs com chips de alta densidade. Author(s): GONÇALVES, A. R.; GIACHETTO, P. F. O objetivo desse estudo foi utilizar uma ferramenta open source, o CNstream (ALONSO et al., 2010), para a identificação de CNVs a partir de dados de genotipagem de bovinos por meio de chips de SNPs da... ... Repository: BDPA Publication year: 2012
Discovery of candidate genes for fatness in chickens based on genotyping with 600K SNP chip in a QTL region. Author(s): MOREIRA, G. C. M.; PÉRTILLE, F.; GODOY, T. F.; BRASSOLOTI, R.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Repository: BDPA Publication year: 2014
Testing a software for paternity exclusion using a high density snp chip and nelore cattle samples. Author(s): MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, F.; SIQUEIRA, A. N.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SILVA, L. O. C. da; REGITANO, L. C. de A. Repository: BDPA Publication year: 2011
Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. Author(s): CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. A produção mundial de café é altamente afetada pelas mudanças climáticas, consequentemente, obter plantas adaptadas a este cenário de clima alterado torna-se muito importante. Com os recentes avanços... ... Repository: BDPA Publication year: 2017
Strategies for single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping to enhance genotype imputation in Gyr (Bos indicus) dairy cattle: Comparison of commercially available SNP chips. Author(s): BOISON, S. A.; SANTOS, D. J. A.; UTSONOMIYA, A. H. T.; CARVALHEIRO, R.; NEVES, H. H. R.; O'BRIEN, A. M. P.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J.; SILVA, M. V. G. B. Genotype imputation is widely used as a cost-effective strategy in genomic evaluation of cattle. Key determinants of imputation accuracies, such as linkage disequilibrium patterns, marker densities, a... ... Repository: BDPA Publication year: 2015
Construção de um pipeline para identificação e análise de CNVs utilizando dados de chips de genotipagem de SNPs. Author(s): PEREIRA, F. C. de P.; GIACHETTO, P. F. O objetivo desse estudo foi construir um pipeline de bioinformática para a identificação e análise de CNVs a partir dos dados gerados pelos chips de genotipagem de SNPs da plataforma Illumina, o qual... ... Repository: BDPA Publication year: 2012
A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. Author(s): SILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. Repository: BDPA Publication year: 2015
Genome-wide SNP allelotyping of the Brazilian maize core collection with the Embrapa multispecies 65k infinium chip. Author(s): ALCÂNTARA, B. de S.; TEIXEIRA, F. F.; SIMIQUELI, G. F.; GRATTAPAGLIA, D. The core collection of the Brazilian Maize germplasm collection (BMCC) with 300 accessions was established in 1999 to represent the genetic diversity of more than the 4000 accessions organized into fo... ... Repository: BDPA Publication year: 2023
Towards GWAS and Genomic Prediction in Coffee: Development and Validation of a 26K SNP Chip for Coffea Canephora. Author(s): ANDRADE, A. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; CARNEIRO, F.; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide SNP genotyping platforms aiming at high-throughput and high-precision genotyping constitute an essential tool to advance breeding by genomic prediction and gene discovery by GWAS. Recent a... ... Repository: BDPA Publication year: 2017
Genomic selection for growth traits in Eucalyptus benthamii and E. pellita populations using a genome-wide Eucalyptus 60K SNPs chip. Author(s): MÜLLER, B. S. F.; NEVES, L. G.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P. R.; KIRST, M.; SANTOS, P. E. T. dos; PALUDZYSZYN FILHO, E.; GRATTAPAGLIA, D. Repository: BDPA Publication year: 2015

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