A Unidade está localizada no município de Jaguariúna, SP, a 570 m de altitude, na latitude de 22º S e longitude de 47º W. Distante aproximadamente 20 km da cidade de Campinas e 130 km da capital do Estado, situa-se numa região considerada como polo tecnológico de Pesquisa e Desenvolvimento, próximo a institutos de pesquisa, dos quais podemos citar: Instituto Agronômico - IAC, Coordenadoria de Assistência Técnica Integral - Cati, Centro de Tecnologia da Informação Renato Archer - CTI, Centro de Pesquisa e Desenvolvimento em Telecomunicações - CPqD, Instituto Biológico de Campinas, Instituto de Tecnologia de Alimentos - Ital, Instituto de Zootecnia - IZ, Laboratório Nacional de Luz Síncrotron - LNLS, Laboratório Nacional de Ciência e Biotecnologia do Etanol - CTBE, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM, além de diversas universidades como Unicamp (campus de Limeira e Campinas), Facamp, PUC Campinas, Unesp (campus de Rio Claro), Unip, Metrocamp, Faculdades Jaguariúna - FAJ e demais Unidades da Embrapa, a saber: Informática Agropecuária (Campinas), Instrumentação Agropecuária (São Carlos), e Territorial (Campinas).