A carne é um dos alimentos mais importantes da dieta da população e possui importância fundamental para a economia do Brasil. Porém, os produtos cárneos são considerados um dos principais responsáveis pela veiculação de patógenos ao homem, ocasionando graves doenças e óbitos. Salmonella sp. e E. coli são considerados os microrganismos patogênicos de maior relevância na carne bovina, sendo sua presença indicativa de risco ao consumidor. O objetivo desse trabalho é gerar uma ferramenta de diagnóstico rápido de Escherichia coli enterohemorrágica (EHEC) O157:H7 e Salmonella spp., baseada em PCR em tempo real multiplex, e compará-la a ferramentas convencionais de diagnóstico, na detecção destes patógenos em carcaças de bovinos em abatedouros.