Quando colhidos com cuidado e mantidos em local fresco, os frutos da pimenta biquinho podem ser mantidos fora da geladeira, por 2 a 3 dias.

Se precisar mantê-los por mais tempo, embale os frutos em saco ou vasilha de plástico ou vidro, e mantenha-os na parte baixa da geladeira. De preferência, não lave os frutos antes de refrigerá-los, mas se precisar fazê-lo, seque bem os frutos com papel toalha ou pano limpo. Nessa condição, podem ser mantidos por até 2 semanas. Com o tempo, tanto em geladeira como em condição ambiente, os frutos murcham e podem apodrecer.

A pimenta biquinho também pode ser congelada. Para isso, lave e seque os frutos, remova os cabinhos antes de colocá-los em saco plástico ou vasilha apropriados para congelamento. Eles podem ser mantidos congelados, por cerca de seis meses. O produto descongelado é indicado para pratos cozidos. A perda de crocância, após o descongelamento, torna a textura dos frutos desagradável para o consumo fresco.

Quando refrigerados e congelados, a perda de aroma é mais acentuada do que a perda de sabor.

Comumente usada para decorar, a biquinho traz mais do que beleza ao prato. Como condimento, ela tem sabor e aroma pronunciados e agradáveis e pode ser usada na forma fresca ou como conserva.

A picância e a cor atraente da biquinho combinam com diferentes preparações, como saladas, sanduíches, hortaliças cozidas e grelhadas, carnes, peixes, arroz, macarrão e farofa. Também pode ser usada para fazer geleia, picles e molhos. Em alguns restaurantes brasileiros, a biquinho é usada até no preparo de bebidas e alguns chefes de cozinha sugerem seu consumo como aperitivo e como fruta.

A pimenta biquinho é uma boa opção para aqueles que gostariam de introduzir as pimentas na alimentação, mas têm muita sensibilidade ao ardor.

Tanto para uso em pratos crus como em pratos cozidos, não é preciso descascar ou remover as sementes dos frutos. Porém, a remoção das sementes pode deixar o fruto com sabor e textura mais agradáveis.