A crise energética mundial tem determinado a necessidade por fontes alternativas de geração de energia. O uso de biodigestores pode além de aumentar a sustentabilidade energética e ambiental da propriedade agropecuária, diminuir a dependência de insumos externos para produção, com a utilização do biofertilizante para produção de alimentos para os animais. A operação de biodigestores para resíduos da produção pecuária inclui o potencial energético do biogás e o uso do efluente na fertirrigação. Este trabalho avaliou a utilização do efluente tratado, como biofertilizante, a otimização da geração de biogás através do aprimoramento do processo de biodigestão, alterando carga orgânica e/ ou tempo de retenção hidráulico, para aumentar a produção de biogás em quantidade e qualidade. O projeto avaliou as características do biofertilizante a ser aplicado em capim elefante cv. Capiaçu, quanto a sua dosagem para maior produção e melhoria da qualidade do solo. Foi realizada identificação de micro-organismos com maior potencial para produção de biogás, a partir da identificação da comunidade microbiana do biodigestor. Também, foi determinado o potencial poluidor do efluente com a verificação da presença de micro poluentes, hormônios. Para esta verificação o projeto incluiu um ensaio in vitro, teste de YES (yeastestrogenscreen). Este teste serve para determinação da dinâmica dos hormônios e seus metabólitos, decorrentes do seu uso no manejo reprodutivo, no campo experimental da Embrapa. Para complementar as avaliações qualitativas e quantitativas dos hormônios foi realizado um levantamento em fazendas de rebanhos comerciais no Brasil, onde foi perguntado sobre a rotina da utilização destas drogas nos rebanhos para a comparação do que ocorre na rotina nas fazendas com o que foi encontrado nos testes laboratoriais. O resultado desta pesquisa gerou conhecimento para otimização do processo de tratamento de dejetos da pecuária leiteira e geração de biogás a partir de biodigestores, e para a aplicação eficiente e segura do efluente como biofertilizante.