As sementes devem ser coletadas de plantações legítimas tanto para as variedades Gigante quanto para a variedade Anã. As plantas matrizes a serem selecionadas para fornecimento de sementes devem apresentar legitimidade e estarem livres de ataques de pragas e doenças; apresentar estipe reto, cicatrizes foliares pouco espaçadas, grande número de folhas (30 a 35), cachos com muitos frutos, os quais devem ser bem apoiados sobre a base das folhas, com pedúnculo curto e numerosas flores femininas. Os frutos devem ser de tamanho médio e grande para coqueiro Gigante e pequeno para o coqueiro Anão.

Com relação à utilização de sementes híbridas, estas somente devem ser adquiridas de fornecedores credenciados, que utilizam as técnicas de polinização controlada para cruzamento, principalmente entre as variedades Gigante e Anã. Este procedimento deve ser supervisionado por pessoal técnico capacitado para que possa assim ser garantida a qualidade das sementes obtidas no que se refere a sua legitimidade. Convém ressaltar que as plantações de coqueiros híbridos originadas por este tipo de semente, não devem ser utilizadas como provedoras de sementes para novos plantios, uma vez que resultam em plantios desuniformes em relação a precocidade de produção e tamanho dos frutos, dentre outras, causando, consequentemente, prejuízos aos produtores.

As sementes a serem utilizadas para produção de mudas devem ser colhidas completamente secas com aproximadamente 11 a 12 meses de idade, e posteriormente estocadas para completar a maturação. Recomenda-se um período de estocagem de 10 dias para sementes de coqueiros Anões, e 21 dias, para coqueiros Gigantes. Deve-se selecionar sementes de tamanho médio, arredondadas, livres da ação de pragas e doenças, e que apresentem sinais de presença de água no seu interior.