A maioria dos microrganismos produtores de antibióticos é comumente encontrada no solo. No entanto, certos endofíticos também têm-se mostrado potentes produtores de antibióticos, dos quais muitos com propriedades de uso na agricultura e na medicina. O taxol, um diterpenóide produzido pela planta Taxus brevifolia e largamente utilizado no tratamento de câncer mamário e de útero, é também produzido por um fungo endofítico, o Taxomyces andreamae  encontrado dentro de T. brevifolia. Alguns compostos de origem vegetal também são produzidos por fungos que habitam esses vegetais, indicando haver uma transposição de genes entre plantas e fungos em uma verdadeira engenharia genética in vivo.

Antibióticos e outros metabólitos produzidos por endofíticos podem ser usados para controle de doenças de plantas. Acremonium caenophialum, um endofítico de gramíneas, têm efeito inibitório sobre vários patógenos. Bactérias do gênero Erwinia ocorrem no interior de plantas de soja e produzem metabólitos que protegem a planta contra o ataque de Pseudomonas syrigae pr. Glycinea.

Actinomicetos, bactérias e fungos estão entre os produtores mais conhecidos. A vasta maioria de antibióticos em uso é produzida por actinomicetos e em particular por membros do gênero Streptomyces. Entre os fungos, Penicillium e Cephalosporium spp. são os mais conhecidos. Bactérias dos gêneros Bacillus e Pseudomonas são também estudadas como produtoras de potentes antibióticos, como B. colistinus, produtor da colistina; B. brevis (tirotricina); B. licheniniformis (gramicidinas); B. polymycia (polimixina, e outros).

Foto: Itamar Soares de Melo

Figura 1. Hifas de Aspergillus ochraceus, produtos de ocratoxina, sendo totalmente parasitada por uma linhagem de Bacillus endofítica, isolada de café