O advento das novas tecnologias de sequenciamento de DNA viabilizaram a concepção e execução de novos projetos, que se baseiem em abordagens como resequenciamento, sequenciamento de novo, genotipagem por sequenciamento, imputação, metagenômica, etc., mas que demandam armazenamento, tratamento e análise de uma quantidade muito grande de dados. O grande desafio deste projeto, na fase II da Rede Genômica Animal (RGA), é, em parceria com o Laboratório Multiusuário de Bionformática da Embrapa (LMB), ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2013

A identificação de genes de interesse econômico pode significar considerável vantagem competitiva em mercados cada vez mais competitivos e globalizados. Genes associados à resistência a pragas, aumento de produtividade e características organolépticas (que podem ser percebidas pelos sentidos humanos, como cor, sabor e textura) valorizadas pelos consumidores são extremamente importantes para a pecuária brasileira. A prospecção deles demanda ferramentas tanto de biotecnologia quanto de bioinformát ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2008

As mudanças climáticas podem afetar a produtividade agrícola e devem impactar a produção de alimentos em um futuro próximo. A criação de cultivares tolerantes a estresses abióticos, como a seca por exemplo, pode ser uma das maneiras de se adaptar as culturas agrícolas a esses efeitos. O processo de criação de cultivares passa pela descoberta de genes, um processo computacional de seleção de genes por meio de análises de bioinformática usando genomas, vias biológicas, dados de expressão gênica, d ...

Situação: concluído     Data de Início: Sat Jul 01 00:00:00 GMT-03:00 2017

As mudanças climáticas podem afetar a produtividade agrícola e devem impactar a produção de alimentos em um futuro próximo. A criação de cultivares tolerantes a estresses abióticos, como a seca, pode ser uma das maneiras de se adaptar as culturas agrícolas a esses efeitos. O processo de criação de cultivares passa pela descoberta de genes, um processo computacional de seleção de genes por meio de análises de bioinformática usando genomas, vias biológicas, dados de expressão gênica, dados da lite ...

Situação: concluído     Data de Início: Tue Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2019

As limitações impostas pelas mudanças climáticas já afetam a produtividade agrícola na maioria das regiões produtoras de alimentos e fibras do mundo e as projeções indicam que o problema deve se intensificar de forma continuada. É imprescindível que ações estruturadas com foco na busca de alternativas viáveis e eficazes sejam intensificadas para fazermos frente aos riscos que ameaçam a produção de alimentos. A Unidade Mista de Pesquisa em Genômica Aplicada a Mudanças Climáticas (Umip GenClima

Situação: concluído     Data de Início: Sat Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2015

A demanda por armazenamento e processamento de grandes volumes de dados em aplicações científicas tem se ampliado consideravelmente na atualidade, exigindo investimentos e aperfeiçoamento técnico por parte das organizações que têm a pesquisa e inovação como sua área fim. A Embrapa não é diferente e já enfrenta em vários de seus projetos um volume expressivo de dados; e percebendo o problema, tem desencadeado ações para mitigá-lo. Como exemplo, pode-se citar a criação do Laboratório Multiusuário ...

Situação: concluído     Data de Início: Mon Oct 01 00:00:00 GMT-03:00 2012

A utilização de técnicas de varredura genômica, como a determinação de regiões de QTLs (quantitative trait loci) e a análise de expressão gênica, pode resultar em centenas e, por vezes, milhares de genes candidatos. Estes genes precisam, então, ser analisados em bancada, o que consome uma grande quantidade de recursos humanos e financeiros. Uma estratégia para lidar com estes conjuntos muito grandes de genes candidatos consiste em minerar os genes mais promissores, ou seja, aqueles com maior cha ...

Situação: concluído     Data de Início: Sat Jan 01 00:00:00 GMT-03:00 2011

Interações proteína-proteína regulam virtualmente todos os processos dentro das células, como transdução de sinais, regulação metabólica, regulação gênica, respostas imunológicas que ocorrem de forma específica. Vários métodos experimentais são capazes de detectar interações entre proteínas que vão desde "resoluções" ao nível celular até experimentos que evidenciam as interações ao nível atômico, porém a performance de experimentos combinados que geram informações completas sobre a rede de in

Situação: concluído     Data de Início: Sat Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2009

O objetivo deste projeto é construir e oferecer ao segmento produtivo da sociedade brasileira um "pipeline", ou seja, um processo de linha de montagem que gera um conhecimento agregado sobre as proteínas oriundas dos projetos genoma iniciados e/ou finalizados no Brasil. Este projeto visa fortalecer as colaborações existentes entre grupos de pesquisa estabelecidos e emergentes, estabelecer outras que auxiliem na obtenção dos resultados esperados e indiquem claramente os procedimentos e técnica

Situação: concluído     Data de Início: Sun Jun 01 00:00:00 GMT-03:00 2008

As enzimas têm sua função determinada essencialmente por alguns resíduos específicos, denominados de resíduos catalíticos. A maioria dos métodos para a predição dos resíduos catalíticos de enzimas utiliza ao menos um critério de conservação da sequência primária. Considerando que a função é decorrente da estrutura, este projeto almeja identificar dentre os descritores estruturais disponíveis na base de dados do sofware Sting aqueles de maior relevância para discriminar os resíduos catalíticos

Situação: concluído     Data de Início: Sun Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2010