A Embrapa Amazônia Ocidental possui uma equipe dedicada a buscar soluções de Pesquisa, Desenvolvimento e Inovação que ajudem a aumentar a produtividade da agricultura no Amazonas e na Amazônia, de modo sustentável, preservando os recursos naturais e a biodiversidade.

Por se tratar de uma Unidade de Pesquisa Ecorregional, a Embrapa Amazônia Ocidental contempla estudos em diversas linhas de atuação, tais como: Aquicultura ; Culturas Alimentares; Plantas Medicinais; Cultura do Cupuaçuzeiro; Cultura da Seringueira; Cultura do Guaranazeiro; Bananicultura; Cultura da Palma de Óleo (Dendê); Sistemas Agroflorestais; Silvicultura e Manejo Florestal; Citricultura; Olericultura (Hortaliças);  Integração Lavoura Pecuária e Floresta; Agricultura sem queima.