As enzimas têm sua função determinada essencialmente por alguns resíduos específicos, denominados de resíduos catalíticos. A maioria dos métodos para a predição dos resíduos catalíticos de enzimas utiliza ao menos um critério de conservação da sequência primária. Considerando que a função é decorrente da estrutura, este projeto almeja identificar dentre os descritores estruturais disponíveis na base de dados do sofware Sting aqueles de maior relevância para discriminar os resíduos catalíticos

Situação: concluído     Data de Início: Sun Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2010

O objetivo deste projeto de pesquisa é atualizar a plataforma STING, com a modernização das ferramentas computacionais para análise e visualização de dados, dando suporte a novas tecnologias de software, além de renovar o maior banco de dados relacional mundial em termos dos descritores físico-químicos e estruturais das estruturas proteicas, o STING_RDB, contribuindo com novos conhecimentos sobre os nanoambientes internos das proteínas mais estudadas no mundo. A atualização da plataforma, que pr ...

Situação: concluído     Data de Início: Sun Dec 01 00:00:00 GMT-03:00 2019

Interações proteína-proteína regulam virtualmente todos os processos dentro das células, como transdução de sinais, regulação metabólica, regulação gênica, respostas imunológicas que ocorrem de forma específica. Vários métodos experimentais são capazes de detectar interações entre proteínas que vão desde "resoluções" ao nível celular até experimentos que evidenciam as interações ao nível atômico, porém a performance de experimentos combinados que geram informações completas sobre a rede de in

Situação: concluído     Data de Início: Sat Aug 01 00:00:00 GMT-03:00 2009

Nas últimas duas décadas, a triagem virtual baseada na estrutura do receptor (SBVS, do inglês structure-based virtual screening) se tornou uma ferramenta útil no processo de planejamento racional de fármacos e agroquímicos. No entanto, apesar de diversos casos de sucesso, a SBVS ainda apresenta limitações, especialmente em relação ao ranqueamento de potenciais ligantes com base na afinidade de ligação. Nesta pesquisa, a partir da análise do nanoambiente de interação proteína-ligante, busca-se es ...

Situação: concluído     Data de Início: Sun Nov 01 00:00:00 GMT-03:00 2015