Autoria: SILVA, A. A.; SILVA, F. F.; SILVA, D. A.; SILVA, H. T.; COSTA, C. N.; LOPES, P. S.; VERONEZE, R.; THOMPSON, G.; CARVALHEIRA, J.

Although several studies have investigated the factors affecting imputation accuracy, most of these studies involved a large number of genotyped animals. Thus, results from these studies cannot be dir... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2019

Autoria: GONÇALVES, A. R.; PEREIRA, F. C. de P.; REGITANO, L. C. de A.; GIACHETTO, P. F.

Data from cattle genotyping using SNP arrays for genome-wide association studies, is widely available at Embrapa. The objective os this study was to use an open source tool, CNstream, for CNV identifi... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2012

Autoria: CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; BANERJEE, P.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N. B; MALHEIROS, J. M.; ZERLOTINI NETO, A.; VIEIRA, D. da S.; FERNANDES, A. C.; CESAR, A. S. M.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.

Here, we reported the impact of these interactions in other omics layers (i.e., microorganisms and metabolites profile in the rumen and stool, and mRNA and miRNA expression in the rumen tissue).

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2022

Autoria: PORTO-NETO, L. R.; SONSTEGARD, T. S.; LIU, G. E.; BICKHART, D. M.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A.; UTSUNOMIYA, Y. T.; GARCIA, J. F.; GONDRO, C.; VAN TASSELL, C. P.

Background - Natural selection has molded evolution across all taxa. At an arguable date of around 330,000 years ago there were already at least two different types of cattle that became ancestors of... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2013

Autoria: REIMANN, F. A.; CAMPOS, G. S.; JUNQUEIRA, V. S.; COMIN, H. B.; SOLLERO, B. P.; CARDOSO, L. L.; COSTA, R. F. da; BOLIGON, A. A.; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F.

This study utilized Bayesian inference in a genome-wide association study (GWAS) to identify genetic markers associated with traits relevant to the adap- tation of Hereford and Braford cattle breeds.... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2024

Autoria: SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B.

Genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping platforms have been widely used in studies in diverse areas, ranging from population genetics to applied genetic improvement and breeding. S... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2014

Autoria: GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; GLATZL JUNIOR, L. A.; ROCHA, R. de F. B.; SANTOS, M. G. dos; OLIVEIRA, D. A. de; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; GUIMARÃES, S. E. F.

Our objective was to establish a SNPs panel for pedigree reconstruction using microarrays of different densities and evaluate the genomic relationship coefficient of the inferred pedigree, in addition... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2023

Autoria: SOLLERO, B. P.; JUNQUEIRA, V. S.; GULIAS GOMES, C. C.; CAETANO, A. R.; CARDOSO, F. F.

Cattle resistance to ticks is known to be under genetic control with a complex biological mechanism within and among breeds. Our aim was to identify genomic segments and tag single nucleotide polymorp... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2017

Autoria: BOISON, S. A.; SANTOS, D. J. A.; UTSONOMIYA, A. H. T.; CARVALHEIRO, R.; NEVES, H. H. R.; O'BRIEN, A. M. P.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J.; SILVA, M. V. G. B.

Genotype imputation is widely used as a cost-effective strategy in genomic evaluation of cattle. Key determinants of imputation accuracies, such as linkage disequilibrium patterns, marker densities, a... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2015

Autoria: BLACKBURN, H. D.; PAIVA, S. R.; SOLLERO, B. P.; BIEGELMEYER, P.; CAETANO, A. R.; CARDOSO, F. F.

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2014