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Identificação de CNVs em bovinos Canchim, a partir de dados de genotipagem de SNPs com chips de alta densidade. Author(s): GONÇALVES, A. R.; GIACHETTO, P. F. O objetivo desse estudo foi utilizar uma ferramenta open source, o CNstream (ALONSO et al., 2010), para a identificação de CNVs a partir de dados de genotipagem de bovinos por meio de chips de SNPs da... ... Repository: BDPA Publication year: 2012
Testing a software for paternity exclusion using a high density snp chip and nelore cattle samples. Author(s): MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, F.; SIQUEIRA, A. N.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SILVA, L. O. C. da; REGITANO, L. C. de A. Repository: BDPA Publication year: 2011
Discovery of candidate genes for fatness in chickens based on genotyping with 600K SNP chip in a QTL region. Author(s): MOREIRA, G. C. M.; PÉRTILLE, F.; GODOY, T. F.; BRASSOLOTI, R.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Repository: BDPA Publication year: 2014
Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. Author(s): CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. A produção mundial de café é altamente afetada pelas mudanças climáticas, consequentemente, obter plantas adaptadas a este cenário de clima alterado torna-se muito importante. Com os recentes avanços... ... Repository: BDPA Publication year: 2017
Strategies for single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping to enhance genotype imputation in Gyr (Bos indicus) dairy cattle: Comparison of commercially available SNP chips. Author(s): BOISON, S. A.; SANTOS, D. J. A.; UTSONOMIYA, A. H. T.; CARVALHEIRO, R.; NEVES, H. H. R.; O'BRIEN, A. M. P.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J.; SILVA, M. V. G. B. Genotype imputation is widely used as a cost-effective strategy in genomic evaluation of cattle. Key determinants of imputation accuracies, such as linkage disequilibrium patterns, marker densities, a... ... Repository: BDPA Publication year: 2015
Construção de um pipeline para identificação e análise de CNVs utilizando dados de chips de genotipagem de SNPs. Author(s): PEREIRA, F. C. de P.; GIACHETTO, P. F. O objetivo desse estudo foi construir um pipeline de bioinformática para a identificação e análise de CNVs a partir dos dados gerados pelos chips de genotipagem de SNPs da plataforma Illumina, o qual... ... Repository: BDPA Publication year: 2012
A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. Author(s): SILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. Repository: BDPA Publication year: 2015
Genome-wide SNP allelotyping of the Brazilian maize core collection with the Embrapa multispecies 65k infinium chip. Author(s): ALCÂNTARA, B. de S.; TEIXEIRA, F. F.; SIMIQUELI, G. F.; GRATTAPAGLIA, D. Repository: BDPA Publication year: 2023
Towards GWAS and Genomic Prediction in Coffee: Development and Validation of a 26K SNP Chip for Coffea Canephora. Author(s): ANDRADE, A. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; CARNEIRO, F.; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide SNP genotyping platforms aiming at high-throughput and high-precision genotyping constitute an essential tool to advance breeding by genomic prediction and gene discovery by GWAS. Recent a... ... Repository: BDPA Publication year: 2017
Genomic selection for growth traits in Eucalyptus benthamii and E. pellita populations using a genome-wide Eucalyptus 60K SNPs chip. Author(s): MÜLLER, B. S. F.; NEVES, L. G.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R.; MUÑOZ, P. R.; KIRST, M.; SANTOS, P. E. T. dos; PALUDZYSZYN FILHO, E.; GRATTAPAGLIA, D. Repository: BDPA Publication year: 2015

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