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Differential allelic expression and co-expression revealed oxidative stress-dependent proteolysis as a key regulator of nelore beef tenderness. Autoria: BRUSCADIN, J. J.; CARDOSO, T. F.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. M. de; AFONSO, J.; VIEIRA, D. da S.; MALHEIROS, J.; ANDRADE, B. G.; PETRINI, J.; FERRAZ, J. B. S.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G.; COUTINHO, L. L. L; REGITANO, L. C. de A. These findings suggest the impact of cis-regulatory variants on both the gene expression and phenotypic variation of Nelore muscle. These results can guide the investigation of regulatory variants aff... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2022
Allele- and parent-of-origin-specific effects on expression of the KCNJ11 gene: a candidate for meat tenderness in cattle. Autoria: SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; TIZIOTO, P. C.; IBELLI, A. M. G.; GASPARIN, G.; ROCHA, M. I. P.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; MUDADU, M. de A.; BARIONI JUNIOR, W.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. In contrast to the Mendelian inheritance model, parental alleles can contribute unequally to gene expression, which may result in phenotypic variance among individuals and bias in the predicted additi... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
Altered expression of the caffeine synthase gene in a naturally caffeine-free mutant of Coffea arabica. Autoria: MALUF, M. P.; SILVA, C. C. da; OLIVEIRA, M. de P. A. de; TAVARES, A. G.; SILVAROLLA, M. B.; GUERREIRO FILHO, O. In this work, we studied the biosynthesis of caffeine by examining the expression of genes involved in this biosynthetic pathway in coffee fruits containing normal or low levels of this substance. The... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2009
Effects of somatic embryogenesis on gene expression of cloned coffee heterozygous hybrids. Autoria: OLIVEIRA, K. C. de; GUIMARÃES, P. de S.; BAZIOLI, J. M.; MARTINATI, J. C.; SANTOS, M. M. dos; PADILHA, L.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. Cloning of superior coffee plants by somatic embryogenesis can assist breeding programs on reducing the cost and time for launch of new cultivars. This study aimed to evaluate the efficiency of this m... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
Electrophoresis and spectrometric analyses of adaptation-related proteins in thermally stressed Chromobacterium violaceum. Autoria: CORDEIRO, I. B.; CASTRO, D. P.; NOGUEIRA, P. P. O.; ANGELO, P. C. S.; NOGUEIRA, P. A.; GONÇALVES, J. F. C.; PEREIRA, A. M. R. F.; GARCIA, J. S.; SOUZA, G. H. M. F.; ARRUDA, M. A. Z.; EBERLIN, M. N.; ASTOLFI-FILHO, S.; ANDRADE, E. V.; LÓPEZ-LOZANO, J. L. Chromobacterium violaceum is a Gram-negative proteobacteria found in water and soil; it is widely distributed in tropical and subtropical regions, such as the Amazon rainforest. We examined protein ex... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2013
Cowpea-Meloidogyne incognita interaction: root proteomic analysis during early stages of nematode infection. Autoria: VILLETH, G. R. C.; CARMO, L. S. T.; SILVA, L. P.; FONTES, W.; GRYNBERG, P.; SARAIVA, M.; BRASILEIRO, A. C. M.; CARNEIRO, R. M. D.; OLIVEIRA, J. T. A.; GROSSI-DE-SA, M. F.; MEHTA, A. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
An integrated analysis of mRNA and sRNA transcriptional profiles in Coffea arabica L. roots: insights on nitrogen starvation responses. Autoria: SANTOS, T. B. dos; SOARES, J. D. M.; LIMA, J. E.; SILVA, J. C.; IVAMOTO, S. T.; BABA, V. Y.; SOUZA, S. G. H.; LORENZETTI, A. P. R.; PASCHOAL, A. R.; MEDA, A. R.; NISHIYAMA JÚNIOR, M. Y.; OLIVEIRA, U. C. de; MOKOCHINSKI, J. B.; GUYOT, R.; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, I. L. M.; FIGUEIR, A. V. O.; MAZZAFERA, P.; R. JÚNIO, O.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S. Coffea arabica L. is an important agricultural commodity, accounting for 60% of traded coffee worldwide. Nitrogen (N) is a macronutrient that is usually limiting to plant yield; however, molecular mec... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
Identification of host proteins modulated by the virulence factor AC2 of tomato chlorotic mottle virus in Nicotiana benthamiana. Autoria: CARMO, L. S. T.; RESENDE, R. O.; SILVA, L. P. da; RIBEIRO, S. da G.; MEHTA, A. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2013
Muscle allele-specific expression QTLs may affect meat quality traits in Bos indicus. Autoria: BRUSCADIN, J. J.; SOUZA, M. M. de; OLIVEIRA, K. S. de; ROCHA, M. I. P.; AFONSO, J.; CARDOSO, T. F.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A. Abstract. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in transcript sequences showing allele-specific expression (ASE SNPs) were previously identified in the Longissimus thoracis muscle of a Nelore... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2021
Gene expression profile during coffee fruit development and identification of candidate markers for phenological stages. Autoria: GASPARI-PEZZOPANE, C. de; BONTURI, N.; GUERREIRO FILHO, O.; FAVARIN, J. L.; MALUF, M. P. The objective of this work was to identify genes that could be used as suitable markers for molecular recognition of phenological stages during coffee (Coffea arabica) fruit development. Four cultivar... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2012

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