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Genome sequencing and de novo assembly of tambaqui (Colossoma macropomum). Autoria: CAETANO, A. R.; IANELLA, P.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. The South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum) is the most important native aquaculture species in Brazil. Current production levels are above 150,000 mt per year. Recent efforts t... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
A draft genome assembly for the forage grass Urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. Autoria: PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E. ABSTRACT: Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, and known for its high nutritional quality. It is closely related to other im... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2018
Genome Sequencing and de novo assembly of the South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer). Autoria: LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; SILVA, N. M. A. da; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. The South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin with an important role in local community and commercial fishing. R... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2016
Computational investigations in eukaryotes genome de novo assembly using short reads. Autoria: CINTRA, L. C. Recently news technologies in molecular biology enormously improved the sequencing data production, making it possible to generate billions of short reads totalizing gibabases of data per experiment.... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2011
A phased diploid genome assembly for the forage grass urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. Autoria: PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E. Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, known for its high nutritional quality. It is closely related to important forage speci... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
Dihaploid Coffea arabica genome sequencing and assembly. Autoria: ANDRADE, A.; PEREIRA, L. F. P. Coffea arabica which accounts for 70% of world coffee production is an allotetraploid with a genome size of approximately 1.3 Gb and is derived from the hybridization of C. canephora (710 Mb) and C. e... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2015
TORNADO: an automated pipeline for de novo hybrid genome assembly based on free software packages for sanger and next generation sequencing technologies (NGS). Next generation sequence technologies (NGS) made possible to sequence entirely genomes in a fast way and low cost, from unicellular to complex organisms, like plants and mammals. These sequences can b... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2010
Reference grade genome sequence assembly for a Brazilian soybean germplasm. Autoria: SILVA JUNIOR, O. B.; MELO, C. L. P. de; ARIAS, C. A. A.; GRATTAPAGLIA, D.; RECH, E. L. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2019
Sequencing and de novo genome assembly of a nelore (Bos indicus) bull. Autoria: CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Bos indicus cattle breeds have been extensively used for dairy and beef production in tropical climates and present several natural adaptations to biotic and abiotic stresses found in these regions of... ... Repositório: BDPA Ano de publicação: 2013
Next generation sequencing and de novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome. Autoria: CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Repositório: BDPA Ano de publicação: 2013

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