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 Autoria: SILVA, A. A.; SILVA, F. F.; SILVA, D. A.; SILVA, H. T.; COSTA, C. N.; LOPES, P. S.; VERONEZE, R.; THOMPSON, G.; CARVALHEIRA, J. Although several studies have investigated the factors affecting imputation accuracy, most of these studies involved a large number of genotyped animals. Thus, results from these studies cannot be dir... ... |
 Autoria: BOISON, S. A.; SANTOS, D. J. A.; UTSONOMIYA, A. H. T.; CARVALHEIRO, R.; NEVES, H. H. R.; O'BRIEN, A. M. P.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J.; SILVA, M. V. G. B. Genotype imputation is widely used as a cost-effective strategy in genomic evaluation of cattle. Key determinants of imputation accuracies, such as linkage disequilibrium patterns, marker densities, a... ... |
 Autoria: CARVALHO, J. R. P. de; MONTEIRO, J. E. B. de A.; NAKAI, A. M.; ASSAD, E. D. Modeling by multiple enchained imputation is an area of growing importance. However, its models and methods are frequently developed for specific applications. In this study the model for multiple imp... ... |
 Autoria: CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CARVALHEIRO, R.; BUZANSKAS, M. E.; ROSA, J. O.; MUDADU, M. de A.; SILVA, M. V. G. B.; MOKRY, F. B.; MARCONDES, C. R.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Genotype imputation has been used to increase genomic information, allow more animals in genome-wide analyses, and reduce genotyping costs. In Brazilian beef cattle production, many animals are result... ... |
 Autoria: CHUD, T. C. S.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL. F. S.; URBINATI, I.; CARVALHEIRO, R.; REGITANO, L. C. de A.; MARCONDES, C. R.; MINARI, D. P.
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 Autoria: OLIVEIRA, A. A. de; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARÃES, C. T.; GUIMARAES, P. E. de O.; PINTO, M. de O.; PASTINA, M. M.; MARGARIDO, G. R. A. Genotyping-by-sequencing (GBS) datasets typically feature high rates of missingness and heterozygote undercalling, prompting the use of data imputation. We compared the accuracy of four imputation met... ... |
 Autoria: PICCOLI, M. L.; BRACINNI NETO, J.; CARDOSO, F. F.; SARGOLZAEI, M.; SCHENKEL, F. S. The main objective of this research was to test alternative low density SNP panels to impute Illumina 50K SNP panel genotypes in Braford and Hereford cattle. Genotypes from 3,768 Hereford, Braford and... ... |
 Autoria: BERNARDES; NASCIMENTO, G. B. do; SAVEGNAGO, R. P.; BUZANSKAS, M. E.; WATANABE, R. N.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L.; GONDRO, C.; MUNARI, D. P. this study compared imputation from lower-density commercial and customized panels to high-density panels and a combined panel (Illumina and Affymetrix) in Nelore beef cattle. Additionally, linkage di... ... |
 Autoria: MUDADU, M. de A.; CARVALHO, H. G. de; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F. The bovine breeding programs in Brazil are trying to adopt the use of genetic markers, a procedure called genomic selection (GS). GS consists in genotyping a given reference population with known phen... ... |
 Autoria: SILVA, F. de L.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; MOURÃO, G. B.; ROSA, G. J. M. Genome wide-association studies (GWAS) generally require large numbers of individuals that are both phenotyped and desenly genotyped for markers across the genome. |
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