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Autoria: BRITO, L. S. de; FERREIRA FILHO, J. A.; SOUZA, M. S.; FORMIGHIERI, E. F.

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2016

Autoria: PEREIRA, F. C. de P.; GIACHETTO, P. F.

O objetivo desse estudo foi construir um pipeline de bioinformática para a identificação e análise de CNVs a partir dos dados gerados pelos chips de genotipagem de SNPs da plataforma Illumina, o qual... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2012

Autoria: CINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P.

In this study we integrated several third-party software code generated by our team to develop a pipeline which detects positive selection in groups of homologous genes.

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2012

Autoria: VERALDI, T. P.; CAMARGO NETO, J.; SANTOS, T. T.; TERNES, S.; SOUZA, K. X. S. de

RESUMO - A detecção de frutos utilizando vídeos, adquiridos em laranjais, é um processo que envolve a utilização de vários sistemas. Cada um é responsável por uma etapa do processo de detecção, sendo... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2021

Autoria: BRANDÃO, M. M.; ARRUDA, L. H.; MOURA, D. S.; NESHICH, G.; PEREIRA, J. G. C.; MALAGÓ, W. Jr; SILVA-FILHO, M. C.

We propose here a computational biology pipeline to identify and analyze possible structural determinants that could explain some level of insensitivity by S. frugiperda serine proteinases (SPs) again... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2010

Autoria: PEREIRA, F. C. de P.; HERAI, R. H.; GONÇALVES, A. R.; REGITANO, L. C. de A.; GIACHETTO, P. F.

The objective of this study was to develop a bioinformatics pipeline for CNV identification and analysis from data generated by high density SNP chips genotyping from Illumina platform, which has been... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2012

Autoria: NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F.

The Genosoja consortium is an initiative to integrate different omics research approaches carried out in Brazil. Basically, the aim of the project is to improve the plant by identifying genes involved... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2012

Autoria: VIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A.

Abstract. The development of genetically modified crops (GM) includes the discovery of candidate genes through bioinformatics analysis using genomics data, gene expression, and others. Proteins of unk... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2021

Autoria: VIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A.

The purpose of this work is to characterize PUFs to be used in GM crops pipelines using orthology, co-expression networks and other tools. To date, we have downloaded, analyzed, and processed genomic... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2019

Autoria: HERAI, R. H.; COSTA, G. G. D. L.; R. JÚNIOR, O.; VIDAL, R. O.; NASCIMENTO, L. C.; PARIZZI, L. P.; PEREIRA, G. G. A.; CARAZZOLLE, M. F.

Next generation sequence technologies (NGS) made possible to sequence entirely genomes in a fast way and low cost, from unicellular to complex organisms, like plants and mammals. These sequences can b... ...

Repositório: BDPA     Ano de publicação: 2010

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