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 Autoria: HONGO, J. A.; CASTRO, G. M. de; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P. Abstract: Background: Detection of genes evolving under positive Darwinian evolution in genome-scale data is nowadays a prevailing strategy in comparative genomics studies to identify genes potentiall... ... |
 Autoria: CASTRO, G. M. de; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. This study comprises the first genomic search for positively selected genes on HSV-1 genome. |
 Autoria: CINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. In this study we integrated several third-party software code generated by our team to develop a pipeline which detects positive selection in groups of homologous genes. |
 Autoria: HONGO, J. A.; CASTRO, G. de; CINTRA, L.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. We present POTION, an open source, modular and end-to-end software for genome-scale detection of positive Darwinian selection in groups of homologous coding sequences. Our software represents a key st... ... |
 Autoria: HONGO, J.; CASTRO, G.; SILVA, F.; CINTRA, L.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. The search for positive selection is also highly parallelizable, since each group of homologous can be analyzed independently. Here we describe POTION (POsitive selecTION), a massively parallel softwa... ... |
 Autoria: DUARTE, I. N. H.; BESSA, A. F. DE O.; ROLA, L. D.; GENUÍNO, M. V. H.; ROCHA, I. M.; MARCONDES, C. R.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P.; BERRY, D. P.; BUZANSKAS, M. E. Analyses of livestock genomes have been used to detect selection signatures, which are genomic regions associated with traits under selection leading to a change in allele frequency. The objective of... ... |
 Autoria: CANAZA-CAYO, A. W.; COBUCI, J. A.; LOPES, P. S.; TORRES, R. de A.; MARTINS, M. F.; DALTRO, D. dos S.; SILVA, M. V. G. B. Annual genetic trends and selection differentials for 305-day milk yield (305MY), age at first calving (AFC), and first calving interval (FCI) were estimated by four selection paths [sires of bulls (S... ... |
 Autoria: MOURA, J. de O.; ROCHA, M. de M.; GOMES, R. L. F.; FREIRE FILHO, F. R.; SILVA, K. J. D. e; RIBEIRO, V. Q. The objective of this study was to estimate the direct and indirect effects of agronomic and culinary traits on iron and zinc contents in 11 cowpea populations. Correlations between traits were estima... ... |
 Autoria: RANGEL, A. H. do N.; ARAÚJO, T. P. M.; LIMA, G. F. da C.; BORBA, L. H. F.; PEIXOTO, M. G. C. D.; LIMA JÚNIOR, D. M. de ABSTRACT Milk production has high economic importance in dairy cattle production systems, which justifies its inclusion in genetic breeding programs. The objective of this study was to evaluate the ge... ... |
 Autoria: CORTEZ, T.; MONTENEGRO, H.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; ANDRADE, S. C. S. Evolutionary history leads to genome changes over time, especially for species that have experienced intense selective pressures over a short period. Here, we investigated the genomic evolution of Bos... ... |
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